אבירי הוספיטלר

בשנת 603, האפיפיור גרגוריוס הראשון הורה על אב המנזר פרובוס, שהיה בעבר שליחו של גרגוריוס בחצר לומברדיה, לבנות בית חולים בירושלים לטיפול ולטפל בעולי רגל נוצרים לארץ הקודש.בשנת 800 הגדיל הקיסר קרל הגדול את בית החולים של פרובוס והוסיף לו ספרייה.כ-200 שנה לאחר מכן, בשנת 1009, הח'ליף הפאטימי אל-חכים בי-עמר אללה הרס את בית החולים ושלושת אלפים מבנים נוספים בירושלים.בשנת 1023 קיבלו סוחרים מאמלפי ומסלרנו שבאיטליה אישור מהח'ליף עלי א-זהיר לבנות מחדש את בית החולים בירושלים.בית החולים שירת על ידי מסדר בנדיקטוס הקדוש, שנבנה במקום בו עמד מנזר יוחנן המטביל, וקלט עולי רגל נוצרים שנסעו לבקר באתרים הקדושים לנוצרים.לפיכך האמינו כי בית החולים של סנט ג'ון נוסד זמן קצר לפני 1070 בירושלים, כתלות בבית הבנדיקטיני של כנסיית מריה הקדושה מהלטינים.הסוחרים האמלפים המייסדים הקדישו את ההוספיס הזה לג'ון המטביל הקדוש, המשקף את בזיליקת הצלב באמלפי שלפני המאה השישית המוקדשת לעליית העלייה.זמן קצר לאחר מכן, נוסד הוספיס שני לנשים שהוקדש לקדושה מריה מגדלנה.בית החולים, במחוז מוריסטן בירושלים, היה אמור לספק טיפול לעולי רגל חולים, עניים או פצועים לארץ הקודש.

מסדר ההוספיטלרים הנזירי נוצר בעקבות מסע הצלב הראשון על ידי הקדוש ברוך הוא ז'רארד דה מרטיגס שתפקידו כמייסד אושר על ידי השור האפיפיור Pie postulatio voluntatis שהוציא האפיפיור פסחאל השני בשנת 1113. ג'רארד רכש שטחים והכנסות למסדר שלו ברחבי ממלכת ירושלים ו מעבר.תחת יורשו, ריימונד דו פוי, הורחב ההוספיס המקורי למרפאה ליד כנסיית הקבר בירושלים.בתחילה טיפלה הקבוצה בעולי רגל בירושלים, אך עד מהרה התרחב הצו לספק לצליינים ליווי חמוש לפני שבסופו של דבר הפכה לכוח צבאי משמעותי.כך הפך מסדר ג'ון הקדוש באופן בלתי מורגש למיליטריסטי מבלי לאבד את אופיו הצדקה.

ריימונד דו פוי, שירש את ג'רארד בתפקיד אדון בית החולים ב-1118, ארגן מיליציה מחברי המסדר, וחילק את המסדר לשלוש דרגות: אבירים, אנשי נשק וכמרים.ריימונד הציע את שירות חייליו החמושים לבולדווין השני מירושלים, והמסדר מזמן זה השתתף במסעות הצלב כמסדר צבאי, ובמיוחד בולט במצור על אסקלון ב-1153.

לאחר הצלחת מסע הצלב הראשון בכיבוש ירושלים בשנת 1099, תרמו צלבנים רבים את רכושם החדש בלבנט לבית החולים של סנט ג'ון.תרומות מוקדמות היו בממלכת ירושלים החדשה שהוקמה, אך עם הזמן הרחיב המסדר את אחזקותיו למדינות הצלבניות של מחוז טריפולי ונסיכות אנטיוכיה.עדויות מצביעות על כך שבשנות ה-1130 המסדר הפך לצבאי כאשר פולק, מלך ירושלים, העניק למסדר את הטירה החדשה שנבנתה בבית גיבלין בשנת 1136. שור של האפיפיור בין השנים 1139 ל-1143 עשוי להצביע על הצו לשכור אנשים כדי להגן על עולי רגל.היו גם מסדרים צבאיים אחרים, כמו האבירים הטמפלרים , שהציעו הגנה לעולי הרגל.

בין 1142 ל-1144 העניק ריימונד השני, רוזן טריפולי, רכוש במחוז למסדר.לפי ההיסטוריון ג'ונתן ריילי-סמית', ההוספיטלרים הקימו למעשה "פלטינה" בתוך טריפולי.הנכס כלל טירות שאיתן היו צפויים ההוספיטלרים להגן על טריפולי .יחד עם Krak des Chevaliers, קיבלו ההוספיטלרים ארבע טירות נוספות לאורך גבולות המדינה, מה שאפשרו למסדר לשלוט באזור.הסכם המסדר עם ריימונד השני קבע שאם הוא לא מלווה אבירי המסדר במערכה, השלל שייך כולו למסדר, ואם הוא נוכח הוא חולק שווה בשווה בין הספירה למסדר.יתר על כן, ריימונד השני לא יכול היה לעשות שלום עם המוסלמים ללא רשות ההוספיטלרים.ההוספיטלרים הפכו את Krak des Chevaliers למרכז מינהל עבור רכושם החדש, תוך כדי עבודה בטירה שתהפוך אותה לאחד הביצורים הצלבניים המשוכללים ביותר בלבנט.

כשהחל מסע הצלב השני ב-1147, ההוספיטלרים היו כוח מרכזי בממלכה וחשיבותו הפוליטית של המאסטר הגדול גדלה.ביוני 1148 במועצת עכו, ריימונד דו פוי היה בין הנסיכים שקיבלו על עצמם את ההחלטה לבצע את המצור על דמשק.האשמה בהפסד הרת האסון שנוצר הוטלה על הטמפלרים , לא על ההוספיטלרים.בארץ הקודש, השפעתם של ההוספיטלרים הפכה לשולטת עם תפקיד מכריע שנלקח במבצעים צבאיים בשל השלטון של ריימונד.

מותו של ג'וברט הסתיים עם מותו בשנת 1177, והוא ירש אותו כמאסטר הגדול על ידי רוג'ר דה מולינס.באותה תקופה, הוקמו ההוספיטלרים את אחד הארגונים הצבאיים החזקים ביותר של הממלכה, בסטייה ממשימת המקור של המסדר.בין פעולותיו הראשונות של רוג'ר הייתה לדחוף את בולדווין הרביעי מירושלים להמשיך לתבוע במרץ את המלחמה נגד צלאח א-דין, ובנובמבר 1177 הוא השתתף בקרב מונטגיסארד, כשהוא זכה בניצחון נגד האיובים.האפיפיור אלכסנדר השלישי קרא להם לחזור לשמירת שלטונו של ריימונד דו פוי בין השנים 1178 ל-1180, והוציא שור שאסר עליהם לאחוז בנשק אלא אם כן יותקפו והפציר בהם לא לנטוש את הטיפול בחולים ובעוני.אלכסנדר השלישי שכנע את רוג'ר לעשות שביתת נשק בשנת 1179 עם הטמפלרי אודו דה סנט אמנד, אז רב מאסטר, גם הוא ותיק מונטגיסארד.

בשנת 1186, ברטרנד מזויר מכר את מרגט להוספיטלרים מכיוון שזה היה יקר מדי לתחזוקה של משפחת מזואר.לאחר בנייה מחדש והרחבה על ידי ההוספיטלרים הפך למפקדה שלהם בסוריה.תחת שליטת הוספיטלר, 14 המגדלים שלה נחשבו בלתי ניתנים לחדירה.רבים מהביצורים הנוצריים היותר משמעותיים בארץ הקודש נבנו על ידי הטמפלרים וההוספיטלרים.בשיאה של ממלכת ירושלים החזיקו ההוספיטלרים בשבעה מבצרים גדולים ועוד 140 אחוזות באזור.רכושו של המסדר חולק לפריוריות, חולק ל-Bailwicks, שבתורם חולקו למפקדים.

קרב האטין בשנת 1187 היה תבוסה הרת אסון עבור הצלבנים: גיא מלוסיניאן, מלך ירושלים, נלכד, וכך גם הצלב האמיתי, שריד שהתגלה במהלך מסע הצלב הראשון .לאחר מכן הורה צלאח א-דין להוציא להורג את האבירים הטמפלרים וההוספיטלרים שנתפסו, כזו הייתה חשיבותם של שני המסדרים בהגנה על המדינות הצלבניות.לאחר הקרב נפלו הטירות ההוספיטלריות של בלמונט, בלבואר ובת'גיבלין לידי צבאות מוסלמים.בעקבות ההפסדים הללו, מיקד המסדר את תשומת ליבו בטירותיו בטריפולי.במאי 1188 הוביל צלאח א-דין צבא לתקוף את קראק דה שבלייר, אך כשראה את הטירה, החליט שהיא מוגנת היטב ובמקום זאת צעד על טירת ההוספיטלר של מרגט, שגם אותה לא הצליח לכבוש.

בשלהי 1189, ארמנגול דה אספה התפטר ומאסטר גדול חדש לא נבחר עד שגרנייה משכם נבחר בשנת 1190. גרנייה נפצע קשה בהאטין בשנת 1187, אך הצליח להגיע לאסקלון והחלים מפצעיו.הוא היה בפריז במשך הזמן הזה וחיכה לריצ'רד הראשון מאנגליה שייצא למסע הצלב השלישי .הוא הגיע למסינה ב-23 בספטמבר, שם פגש את פיליפ אוגוסט ורוברט הרביעי דה סאבלה, בקרוב המאסטר הגדול של הטמפלרים .גרנייה עזב את מסינה ב-10 באפריל 1191 עם הצי של ריצ'רד, שעגן אז ב-1 במאי בנמל למסוס.ריצ'רד הכניע את האי ב-11 במאי למרות תיווכו של גרנייה.הם הפליגו שוב ב-5 ביוני והגיעו לעכו, בשליטה איובית מאז 1187. שם הם מצאו את פיליפ אוגוסט מוביל את המצור על עכו, ניסיון של שנתיים לעקור את המוסלמים.בסופו של דבר יד הנצורים עלתה על העליונה, ותחת עיניו חסרות האונים של צלאח א-דין, נכנעו המגינים המוסלמים ב-12 ביולי 1191.ב-22 באוגוסט 1191 נסע ריצ'רד דרומה לארסוף.הטמפלרים יצרו את החלוץ וההוספיטלרים במשמר האחורי.ריצ'רד נסע עם כוח מובחר שהיה מוכן להתערב במידת הצורך.ההוספיטלרים הותקפו ב-7 בספטמבר, בתחילת קרב ארסוף.ממוקם בחלק האחורי של הטור הצבאי, אביריו של גרנייה היו תחת לחץ כבד מצד המוסלמים והוא רכב קדימה כדי לשכנע את ריצ'רד לתקוף, דבר שהוא סירב.לבסוף, גרנייה ואביר נוסף הסתערו קדימה, ועד מהרה הצטרפו אליהם שאר הכוח ההוספיטלרי.ריצ'רד, למרות העובדה שפקודותיו לא נשמעו, סימן להאשים מלאה.זה תפס את האויב ברגע פגיע, ושורותיהם נשברו.לגרנייה היה אם כן חלק גדול בניצחון בקרב, אם כי בניגוד לפקודותיו של ריצ'רד.

גוארין דה מונטאיגו נבחר למאסטר הגדול בקיץ 1207. הוא תואר כ"דמותו של אחד המאסטרים הגדולים ביותר שלבית החולים יש סיבה להתגאות בו".מאמינים שהוא אחיו של פייר דה מונטאיגו ששימש כמאסטר הגדול הטמפלרי מ-1218 עד 1232. כמו שני קודמיו, מונטאיגו מצא את עצמו מעורב בענייני אנטיוכיה במלחמת הירושה באנטיוקנה, שהחלה עם פתיחתו של צוואתו של בוהמונד השלישי מאנטיוכיה.הצוואה כיוון את נכדו ריימונד-רופן כיורש.בוהמונד הרביעי מאנטיוכיה, בנו השני של בוהמונד השלישי ורוזן טריפולי, לא קיבל צוואה זו.ליאו הראשון מארמניה, בתור הדוד הגדול מצד האם, לקח את הצד של ריימונד-רופן.עם זאת, מבלי לחכות למותו של אביו, בוהמונד הרביעי השתלט על הנסיכות.הטמפלרים התיישרו עם הבורגנות של אנטיוכיה ואז-זהיר ע'אזי, הסולטן האיובי של חלב, בעוד שההוספיטלרים צידדו בריימונד-רופן ובמלך ארמניה .כשדה מונטאיגו השתלט על ההוספיטלרים, שום דבר לא השתנה.ליאו הראשון מארמניה הפך את עצמו לאדון באנטיוכיה והקים שם מחדש את אחיינו.אבל זה היה קצר, וכפי שהרוזן מטריפולי נשאר אדון העיר.ליאו הראשון תמך בטענותיו על ידי החרמת רכושם של הטמפלרים בקיליציה, הרס המסחר של אנטיוכיה בפשיטות, ואף הסתכן בנידוי בשנים 1210–1213.הושג הסכם בין המלך לטמפלרים, והנידוי בוטל.ב-14 בפברואר 1216, אנטיוכיה הועברה לידי ליאו הראשון ושל אחיינו ריימונד-רופן.האצולה האנטיוכית אפשרה את שובו של בוהמונד הרביעי ואת בריחתו של ריימון-רופן, שמת מאוחר יותר ב-1222.בוהמונד הרביעי נקם את נקמתו בהוספיטלרים, ולקח מהם בחזרה את טירת אנטיוכיה ורכושם בטריפולי התערער.הונוריוס השלישי התערב לטובתם בשנים 1225 ו-1226, ויורשו גרגוריוס התשיעי הרחיק את בוהמונד הרביעי בשנת 1230. הוא אישר לג'רלד מלוזאן, הפטריארך הלטיני של ירושלים, להסיר את האיסור אם בוהמונד יסכים לעשות שלום עם ההוספיטלרים.בתיווכם של ג'רלד והאיבלינים, בוהמונד וההוספיטלרים הסכימו להסכם שנחתם ב-26 באוקטובר 1231. בוהמונד אישר את זכותם של ההוספיטלרים להחזיק בג'בלה ובמבצר סמוך והעניק להם גזלות כסף הן בטריפולי והן באנטיוכיה.ההוספיטלרים ויתרו על ההרשאות שריימונד-רופן העניק להם.תוך זמן קצר, ג'ראלד מלוזאן הסיר את הנידוי ושלח את ההסכם לרומא לאישור הכס הקדוש.

בשנת 1244 איפשרו האיובים לחוואראזמיאנים, שהמונגולים נהרסה באימפריה ב-1231, לתקוף את העיר.הטמפלרים החלו לבצר את העיר ירושלים בשנת 1244 כאשר התרחשה פלישת חווארזמיאן, כוח שהוזמן על ידי א-סאלח איוב, הסולטן שלמצרים .הם כבשו את טבריה, צפת וטריפולי והחלו במצור על ירושלים ב-15 ביולי 1244. בגלל ההסכם בין פרידריך השני לאל-קמיל, החומות לא היו מבוצרות מספיק ולא יכלו לעמוד במתקפה.הפטריארך של ירושלים רוברט מנאנט ומנהיגי הטמפלרים וההוספיטלרים הגיעו לתמוך בתושבי העיר והדפו בתחילה את התוקפים.הקסטלאן הקיסרי והמפקד הגדול של בית החולים איבדו את חייהם בקרב, אבל שום עזרה מהפרנקים לא הגיעה.העיר נפלה במהירות.החוואראזמיאנים שדדו את הרובע הארמני, שם חיסלו את האוכלוסייה הנוצרית , וגירשו את היהודים.בנוסף, הם בזזו את קברי מלכי ירושלים בכנסיית הקבר וחפרו את עצמותיהם, שבהן הפכו קברי בולדווין הראשון וגודפרי מבוליון לצנוטפים.ב-23 באוגוסט, מגדל דוד נכנע לכוחות החוואראזמיאן, כ-6,000 גברים, נשים וילדים נוצרים יצאו מירושלים.האבירים ההוספיטלרים והטמפלרים העבירו את המטה שלהם לעיר עכו.

לאחר נפילת ירושלים, הורכב כוח משולב, המורכב מטמפלרים , ההוספיטלרים והאבירים הטבטונים , שהצטרף לצבא מוסלמי של סורים ועבר-הירדן בפיקודו של אל-מנצור איברהים וא-נאסיר דא'וד.צבא זה הופקד בפיקודו של וולטר הרביעי מבריאן ועזב את עכו, כיום מפקדת המסדר, ויצא ב-4 באוקטובר 1244. הם נפלו על החווארזמיאנים ועל הכוחותהמצריים בפיקודו של בייבאר, סולטן מצריםהממלוכי לעתיד. 17 באוקטובר.בקרב לה פורבי ליד עזה, נשרו בעלות הברית המוסלמים של הפרנקים במפגש הראשון עם האויב והנוצרים מצאו את עצמם לבד.הלחימה הבלתי שוויונית הסתיימה באסון - 16,000 איש איבדו את חייהם ו-800 נלקחו בשבי, ביניהם 325 אבירים ו-200 טורקופוליאים של ההוספיטלרים.גיום דה שאטונאף עצמו נתפס ונלקח לקהיר.רק 18 טמפלרים ו-16 הוספיטלרים הצליחו להימלט.הניצחון האיובי שנוצר הוביל לקריאה למסע הצלב השביעי וסימן את קריסת הכוח הנוצרי בארץ הקודש.

בשנת 1248 אישר האפיפיור אינוקנטיוס הרביעי שמלה צבאית סטנדרטית עבור ההוספיטלרים ללבוש במהלך הקרב.במקום שכמייה סגורה מעל השריון שלהם (שהגביל את תנועותיהם), הם לבשו מעיל אדום עם צלב לבן מעוטר עליו.

ב-3 במרץ 1271 הגיע צבאו של הסולטןהממלוכי באיבארס ל-Krak des Chevaliers.כשהסולטן הגיע, ייתכן שהטירה כבר נחסמה על ידי הכוחות הממלוכים למשך מספר ימים.ישנם שלושה דיווחים בערבית על המצור;רק אחד, זה של אבן שדד, היה על ידי בן זמנו למרות שהוא לא נכח.איכרים שהתגוררו באזור נמלטו לטירה ליתר ביטחון והוחזקו במחלקה החיצונית.ברגע שבאיברס הגיע הוא החל להקים מנגונלים, כלי נשק מצור עוצמתיים אותם יפנה על הטירה.לפי אבן שדד, יומיים לאחר מכן נכבש קו ההגנה הראשון על ידי הנצורים;הוא כנראה התכוון לפרבר מוקף חומה מחוץ לכניסה של הטירה.גשם קטע את המצור, אך ב-21 במרץ נתפסה משולש מיד דרומית ל-Krak des Chevaliers, אולי מוגן על ידי פליזת עצים.ב-29 במרץ התערער המגדל בפינה הדרום-מערבית והתמוטט.צבאו של באיבר תקף דרך הפרצה ובכניסה למחלקה החיצונית שם נתקלו באיכרים שביקשו מקלט בטירה.למרות שהמחלקה החיצונית נפלה, ותוך כדי כך נהרגו קומץ מחיל המצב, נסוגו הצלבנים אל המחלקה הפנימית האדירה יותר.לאחר רגיעה של עשרה ימים, העבירו הנצורים מכתב לחיל המצב, כביכול מאסטר הגדול של האבירים ההוספיטלרים בטריפולי שהעניק להם רשות להיכנע.למרות שהמכתב היה זיוף, חיל המצב נכנע והסולטן חס על חייהם.הבעלים החדשים של הטירה ביצעו תיקונים, שהתמקדו בעיקר במחלקה החיצונית.הקפלה ההוספיטלרית הוסבה למסגד ונוספו שני מיהראבים לפנים.

המצור על עכו (נקרא גם נפילת עכו) התרחש בשנת 1291 והביא לכך שהצלבנים איבדו את השליטה בעכו לידיהממלוכים .זה נחשב לאחד הקרבות החשובים של התקופה.למרות שהתנועה הצלבנית נמשכה עוד כמה מאות שנים, כיבוש העיר סימן את סוף מסעי הצלב הנוספים ללבנט.עם נפילת עכו איבדו הצלבנים את מעוזם הגדול האחרון של ממלכת ירושלים הצלבנית.הם עדיין החזיקו מבצר בעיר טרטוס שבצפון המדינה (היום בצפון-מערב סוריה), עסקו בכמה פשיטות חופיות וניסו לחדור מהאי הקטנטן רואד, אבל כשאיבדו גם את זה ב-1302 במצור על רואד, הצלבנים כבר לא שלטו באף חלק של ארץ הקודש.אחרי עכו חיפשו האבירים ההוספיטלרים מקלט בממלכת קפריסין.

ההוספיטלרים עברו לממלכת קפריסין בעקבות נפילת עכו.מצא מקלט בלימסול בטירת קולוסי, ז'אן דה וילייר ערך פרק כללי של המסדר ב-6 באוקטובר 1292. הוא רצה להעמיד את ההוספיטלרים בעמדה לכבוש מחדש את ארץ הקודש.הוא התכונן להגנת קפריסין ולהגנה על ארמניה, שתיהן היו מאוימות על ידיהממלוכים .הסתבך בפוליטיקה הקפריסאית, דה וילארט יצר תוכנית לרכוש תחום זמני חדש, האי רודוס, שהיה אז חלק מהאימפריה הביזנטית.לאחר אובדן עכו, יחסי הכוחות בארץ הקודש בין הנוצרים לממלוכים היו בעליל לטובתם של האחרונים, שהמשיכו להתקדם.עם זאת, הנוצרים יכלו לסמוך על המונגולים של פרס בראשות מחמוד ע'זאן חאן, שההתפשטות שלו דחפה אותם לחמוד את האדמות הממלוכיות.צבאו כבש את חאלב, ושם הצטרף אליו הוסאל שלו הת'ום השני מארמניה , שכוחותיו כללו כמה טמפלרים והוספיטלרים, שכולם השתתפו בשאר המתקפה.המונגולים ובני בריתם הביסו את הממלוכים בקרב השלישי על חומסין בדצמבר 1299. החאן שלח שגריר לניקוסיה כדי להקים ברית.הנרי השני מקפריסין, התום השני והמאסטר הגדול הטמפלרי ז'אק דה מולאי החליטו ללוותו לאפיפיור כדי לתמוך ברעיון של ברית, שנכנסה לתוקף בשנת 1300.מלך קפריסין שלח צבא לארמניה מלווה ב-300 אבירים משני המסדרים בראשות האישית של המאסטרים הגדולים.הם הסתערו על האי רואד, הסמוך לחוף הסורי, במטרה להפוך אותו לבסיס לפעולותיהם העתידיות.לאחר מכן הם כבשו את עיר הנמל טורטוסה, בזזו את האזור, לכדו מוסלמים רבים ומכרו אותם כעבדים בארמניה בזמן שהמתינו לבואם של המונגולים, אבל זה רק הוביל לנפילת רואד, הקרב האחרון על ארץ הקודש.

כאשר ההוספיטלרים נסוגו לקפריסין, האי נשלט על ידי מלך ירושלים הנרי השני מקפריסין.הוא פחות היה מרוצה מכך שארגון חזק כמו המסדר יכול להתחרות בו על הריבונות של האי הקטן שלו, וסביר להניח שהעלה את גיום דה ויארט על הנתיב לכבוש את האי רודוס.על פי ז'רארד דה מונריאל, ברגע שנבחר לאסטר הגדול של האבירים ההוספיטלרים בשנת 1305, תכנן פולקס דה וילארט את כיבוש רודוס, מה שיבטיח לו חופש פעולה שלא יוכל להיות לו כל עוד המסדר נשאר על קפריסין, ויספק בסיס חדש למלחמה נגד הטורקים.רודוס הייתה יעד אטרקטיבי: אי פורה, הוא היה ממוקם אסטרטגית מול החוף הדרום-מערבי של אסיה הקטנה, על פני נתיבי הסחר לקונסטנטינופול או לאלכסנדריה וללבנט.האי היה נחלה ביזנטית, אך האימפריה החלשה יותר ויותר לא הצליחה להגן על נכסיה המבודדים, כפי שהוכח בתפיסת כיוס ב-1304 על ידי הגנואה בנדטו זקריה, שהבטיח את ההכרה ברשותו מהקיסר אנדרוניקוס השני פלאיולוגוס (ר. 1282–1328), והפעילויות המתחרות של הגנואים והוונציאנים באזור הדודקאנס.הכיבוש ההוספיטלרי של רודוס התרחש בשנים 1306–1310.האבירים ההוספיטלרים, בראשות הגראנד מאסטר פולק דה וילארט, נחתו על האי בקיץ 1306 וכבשו במהירות את רובו מלבד העיר רודוס, שנותרה בידיים ביזנטיות.הקיסר אנדרוניקוס השני פלאיולוגוס שלח תגבורת, שאפשרה לעיר להדוף את התקפות ההוספיטלרים הראשוניות, ולהתמיד עד שנכבשה ב-15 באוגוסט 1310. ההוספיטלרים העבירו את בסיסם לאי, שהפך למרכז פעילותם עד שנכבש על ידי האימפריה העות'מאנית בשנת 1522.

במהלך מסע הצלב הסמירוני בשנת 1344, ב-28 באוקטובר, כבשו הכוחות המשולבים של האבירים ההוספיטלרים של רודוס, הרפובליקה של ונציה , מדינות האפיפיור וממלכת קפריסין הן את הנמל והן את העיר מידי הטורקים, שאותם החזיקו במשך כמעט 60 שנה;המצודה נפלה ב-1348, עם מותו של המושל עומור בהא א-דין עזי.בשנת 1402 הסתער טמרלן על העיירה וטבח כמעט את כל התושבים.כיבושו של טימור היה זמני בלבד, אך סמירנה הוחזרה על ידי הטורקים תחת שושלת אידין ולאחר מכן היא הפכה לעות'מאנית , כאשר העות'מאנים השתלטו על אדמות אידין לאחר 1425.

מול הסולטנות העות'מאנית שהוקמה כעת היטב, האבירים ההוספיטלרים, שהמפקדה שלהם הייתה באי רודוס, נזקקו למעוז נוסף ביבשת.המאסטר הגדול פיליבר דה נאילאק (1396–1421) זיהה אתר מתאים מול האי קוס, בו כבר נבנתה טירה על ידי המסדר.מיקומה היה אתר של ביצור בתקופה הדורית (1110 לפנה"ס) וכן של טירה סלג'וקי קטנה במאה ה-11.בניית הטירה החלה בשנת 1404 בפיקוחו של אדריכל האביר הגרמני היינריך שלגלהולט.לפועלי הבניין הובטחה שמורה בגן עדן על ידי צו האפיפיור משנת 1409. הם השתמשו באבן וולקנית ירוקה בריבוע, עמודי שיש ותבליטים מהמאוזוליאום הסמוך של הליקרנסוס כדי לבצר את הטירה.הטירה הותקפה עם עליית האימפריה העות'מאנית, תחילה לאחר נפילת קונסטנטינופול ב-1453 ושוב ב-1480 על ידי הסולטן מהמד השני .ההתקפות נהדפו על ידי אבירי סנט ג'ון.כשהאבירים החליטו לבצר את הטירה ב-1494, הם השתמשו שוב באבנים מהמוזוליאום.החומות שפונות ליבשת עובו על מנת לעמוד בכוח ההרס הגובר של תותחים.החומות שפונות לים היו פחות עבות, מכיוון שלמסדר לא היה מה לחשוש מהתקפה ימית בגלל הצי הימי החזק שלהם.המאסטר הגדול פבריציו דל קארטו (1513–21) בנה מעוז עגול כדי לחזק את הצד היבשתי של המצודה.למרות הביצורים הנרחבים שלהם, מגדלי הצלבנים לא עמדו בקנה אחד עם כוחותיו של סולימן המפואר, שגבר על האבירים בשנת 1523. תחת השלטון העות'מאני דעכה חשיבותה של הטירה, ובשנת 1895 היא הוסבה לכלא.

ברודוס ההוספיטלרים, שכונו עד אז גם כאבירי רודוס, נאלצו להפוך לכוח צבאי יותר, שנלחם במיוחד בשודדי הים הברבריים.הם עמדו בשתי פלישות במאה ה-15, אחת של הסולטאן שלמצרים ב-1444 ואחרת של הסולטן העות'מאני מהמד הכובש ב-1480, שלאחר כיבוש קונסטנטינופול והביס את האימפריה הביזנטית ב-1453, הפך את האבירים ליעד עדיפות.בשנת 1522, הגיע כוח מסוג חדש לחלוטין: 400 ספינות בפיקודו של הסולטן סולימאן המפואר העבירו 100,000 איש לאי (200,000 במקורות אחרים).נגד הכוח הזה היו לאבירים, בפיקודו של הגדול מאסטר פיליפ וילייר דה ל'אי-אדם, כ-7,000 חיילים בנשק וביצוריהם.המצור נמשך שישה חודשים, שבסופו הורשו ההוספיטלרים המובסים ששרדו לסגת לסיציליה.למרות התבוסה, נראה שגם הנוצרים וגם המוסלמים התייחסו להתנהלותו של פיליפ וילייר דה ל'אי-אדם כאמיצה ביותר, והמאסטר הגדול הוכרז כמגן האמונה על ידי האפיפיור אדריאן השישי.

טריפולי, כיום עיר הבירה של לוב, נשלטה על ידי האבירים ההוספיטלרים בין השנים 1530 ל-1551. העיר הייתה תחת שלטון ספרדי במשך שני עשורים לפני שהוענקה כבית להוספיטלרים בשנת 1530 יחד עם האיים מלטה וגוזו. .ההוספיטלרים התקשו לשלוט בעיר ובאיים, ולעתים הציעו להעביר את המטה שלהם לטריפולי או לנטוש ולהרוס את העיר.השלטון ההוספיטלרי על טריפולי הסתיים ב-1551 כאשר העיר נכבשה על ידי האימפריה העות'מאנית בעקבות מצור.

בהיותם היושבים במלטה, המסדר והצי שלו השתתפו במספר קרבות ימיים נגד הצי העות'מאני או שודדי הים הברבריים.המסדר שלח קראק וארבע גליות לתמוך באימפריה הספרדית ובעלות בריתה בכיבוש תוניס בשנת 1535. הוא השתתף גם בקרב פרבזה (1538), משלחת אלג'יר (1541) ובקרב ג'רבה (1560), שבו ניצחו העות'מאנים על הכוחות הנוצרים.ארבע מהמטבחים של המסדר, סנטה פה, סן מיקלה, סן פיליפו וסן קלאודיו, התהפכו בטורנדו בנמל הגדול בשנת 1555. הם הוחלפו בכספים שנשלחו מספרד, מדינות האפיפיור, צרפת והפריור של סנט ג'יילס .גאליה אחת נבנתה על חשבון המאסטר הגדול קלוד דה לה סנגלה.כאשר העיר ולטה החלה להיבנות בשנות ה-60 של המאה ה-19, היו תוכניות לבנות ארסנל ומנדרצ'יו עבור הצי של המסדר.הארסנל מעולם לא נבנה, ובזמן שהתחילו העבודה על המנדרצ'יו, הוא נעצר והאזור הפך לשכונת עוני הידועה בשם מנדראג'יו.בסופו של דבר, נבנה ארסנל בבירגו בשנת 1597. רציף נבנה בתעלה של ולטה בשנת 1654, אך הוא נסגר ב-1685.

אפילו כששרד על מלטה, המסדר איבד רבות מאחזקותיו האירופיות במהלך הרפורמציה הפרוטסטנטית.רכושו של הסניף האנגלי הוחרם בשנת 1540. הביאיוויק הגרמני של ברנדנבורג הפך לותרני ב-1577, אז אוונגליסטי באופן רחב יותר, אך המשיך לשלם את תרומתו הכספית למסדר עד 1812, אז מגן המסדר בפרוסיה, המלך פרידריך. ויליאם השלישי, הפך אותו לסדר הצטיינות.

המצור הגדול על מלטה התרחש בשנת 1565 כאשר האימפריה העות'מאנית ניסתה לכבוש את האי מלטה, שהוחזק אז על ידי האבירים ההוספיטלרים.המצור נמשך כמעט ארבעה חודשים, מ-18 במאי עד 11 בספטמבר 1565.מטה האבירים ההוספיטלר היה במלטה מאז 1530, לאחר שגורשו מרודוס, גם הם על ידי העות'מאנים, ב-1522, בעקבות המצור על רודוס.העות'מאנים ניסו לראשונה לכבוש את מלטה בשנת 1551 אך נכשלו.בשנת 1565, סולימאן המפואר, הסולטן העות'מאני, עשה ניסיון שני לכבוש את מלטה.האבירים, שמנו כ-500 יחד עם כ-6,000 חיילים רגלים, עמדו במצור והדפו את הפולשים.ניצחון זה הפך לאחד האירועים המפורסמים ביותר של אירופה של המאה השש עשרה, עד כדי כך שוולטר אמר: "שום דבר אינו ידוע יותר מהמצור על מלטה".זה ללא ספק תרם לשחיקה בסופו של דבר של התפיסה האירופית של אי-מנוצחיות עות'מאנית, אם כי הים התיכון המשיך להיות מתמודד בין קואליציות נוצריות לבין הטורקים המוסלמים במשך שנים רבות.המצור היה שיאו של תחרות הסלמה בין הבריתות הנוצריות לבין האימפריה העות'מאנית האסלאמית על השליטה בים התיכון, תחרות שכללה את המתקפה הטורקית על מלטה ב-1551, השמדת צי נוצרי בעלות הברית בקרב ג'רבה ב-1551. 1560, והתבוסה העות'מאנית המכריעה בקרב לפנטו ב-1571.

לאחר העברת האבירים למלטה, הם מצאו את עצמם חסרי סיבת קיומם הראשונית: סיוע והצטרפות למסעות הצלב בארץ הקודש היו כעת בלתי אפשריים, מסיבות של חוסן צבאי ופיננסי לצד מיקום גיאוגרפי.עם ירידה בהכנסות מספונסרים אירופיים שאינם מוכנים עוד לתמוך בארגון יקר וחסר משמעות, האבירים פנו לשיטור הים התיכון מפני האיום המוגבר של פיראטיות, בעיקר מהאיום של הפיראטים הברבריים שאושרו על ידי העות'מאניים הפועלים מקו החוף של צפון אפריקה.מחוזקים לקראת סוף המאה ה-16 באווירה של בלתי מנוצחת בעקבות ההגנה המוצלחת על האי שלהם ב-1565 ונוספו על ידי הניצחון הנוצרי על הצי העות'מאני בקרב לפנטו ב-1571, האבירים החלו להגן על ספנות סוחר נוצרית מהלבנט ושחרור העבדים הנוצרים השבויים שהיוו את הבסיס למסחר הפיראטי ולצי הים של הברברים.זה נודע בשם "קורסו".השלטונות במלטה הכירו מיד בחשיבות הגיוס לכלכלתן והתחילו לעודד אותה, שכן למרות נדרי העוני, קיבלו האבירים את היכולת לשמור על חלק מהספגליו, שהיה כספי הפרסים והמטען שהושגו מ- ספינה שנתפסה, יחד עם היכולת להתאים למטבחים שלהם את העושר החדש שלהם.המחלוקת הגדולה שאפפה את קורסו של האבירים הייתה התעקשותם על מדיניות ה'וויסטה' שלהם.זה איפשר למסדר לעצור ולעלות על כל המשלוחים החשודים בהובלת סחורה טורקית ולהחרים את המטען שיימכר מחדש בוולטה, יחד עם צוות הספינה, שהיו ללא ספק הסחורה היקרה ביותר על הספינה.מטבע הדברים מדינות רבות טענו שהן קורבנות ללהיטות יתר של האבירים לעצור ולהחרים כל סחורה הקשורה מרחוק לטורקים.במאמץ להסדיר את הבעיה ההולכת וגוברת, הקימו השלטונות במלטה בית משפט שיפוטי, Consiglio del Mer, שבו קברניטים שחשו שנעשה להם עוול יכלו לטעון בטענתם, לעתים קרובות בהצלחה.הנוהג של הנפקת רישיונות פרטיות ובכך אישור המדינה, שהיה קיים במשך מספר שנים, היה מוסדר בקפדנות כאשר ממשלת האי ניסתה לגרור את האבירים חסרי המצפון ולפייס את המעצמות האירופיות ואת הנדיבים המוגבלים.אולם מאמצים אלה לא היו מוצלחים לחלוטין, מכיוון שהקונסיליו דל מר קיבל תלונות רבות בסביבות שנת 1700 על פיראטיות מלטזית באזור.בסופו של דבר, התמכרות היתר המשתוללת בפרטיות בים התיכון הייתה אמורה להיות נפילתם של האבירים בתקופה הספציפית הזו של קיומם, כאשר הם הפכו משירתם כמאחז הצבאי של הנצרות המאוחדת להפיכתם למדינת לאום נוספת ביבשת בעלת אוריינטציה מסחרית. בקרוב יעקפו מדינות המסחר של הים הצפוני.

הצי ההוספיטלרי השתתף במספר מהמלחמות העות'מאניות-ונציאניות במאה ה-17 ובתחילת המאה ה-18.מעורבות בולטת הייתה הפעולה ב-28 בספטמבר 1644, שהובילה לפרוץ מלחמת כרתים.חיל הים הגיע לשיאו בשנות השמונים של המאה ה-16, בתקופת שלטונו של גרגוריו קראפה.בשלב זה הוגדלה המחסן בבירגו.

בשלושת העשורים האחרונים של המאה השמונה עשרה, המסדר חווה דעיכה מתמדת.זה היה תוצאה של מספר גורמים, כולל פשיטת הרגל שהייתה תוצאה של שלטונו המפואר של פינטו, שייבש את כספי המסדר.בשל כך, המסדר הפך ללא פופולרי גם בקרב המלטזים.בשנת 1775, בתקופת שלטונו של פרנסיסקו שימנז דה טג'דה, התרחש מרד הידוע בשם עליית הכוהנים.המורדים הצליחו לכבוש את פורט סנט אלמו ואת סנט ג'יימס קאבלייר, אך המרד דוכא וחלק מהמנהיגים הוצאו להורג בעוד שאחרים נכלאו או הוגלו.בשנת 1792, רכוש המסדר בצרפת נתפס על ידי המדינה עקב המהפכה הצרפתית, שהובילה את המסדר שכבר פשט רגל למשבר פיננסי גדול עוד יותר.כשנפוליאון נחת במלטה ביוני 1798, יכלו האבירים לעמוד במצור ארוך, אך הם נכנעו על האי כמעט ללא קרב.

בשנת 1798, במהלך משלחתו של נפוליאון למצרים , כבש נפוליאון את מלטה.נפוליאון דרש מהמאסטר הגדול פרדיננד פון הומפש זו בולהיים לאפשר לאניותיו להיכנס לנמל ולקבל מים ואספקה.המאסטר הגדול השיב שניתן לאפשר רק שתי ספינות זרות להיכנס לנמל בכל פעם.בונפרטה, שהיה מודע לכך שהליך כזה ייקח זמן רב מאוד וישאיר את כוחותיו חשופים לאדמירל נלסון, הורה מיד על חילוץ תותחים נגד מלטה.החיילים הצרפתים ירדו במלטה בשבע נקודות בבוקר ה-11 ביוני ותקפו.לאחר מספר שעות של לחימה עזה, המלטזים במערב נאלצו להיכנע.נפוליאון פתח במשא ומתן עם בירת המבצר ולטה.מול כוחות צרפתיים עדיפים בהרבה ואובדן מערב מלטה, ניהל המאסטר הגדול משא ומתן על כניעה לפלישה.הומפש עזב את מלטה לטריאסטה ב-18 ביוני.הוא התפטר כמאסטר הגדול ב-6 ביולי 1799.האבירים פוזרו, אם כי המסדר המשיך להתקיים בצורה מופחתת וניהל משא ומתן עם ממשלות אירופה לחזרה לשלטון.הקיסר הרוסי , פאול הראשון, העניק למספר האבירים הגדול ביותר מחסה בסנט פטרסבורג, פעולה אשר הולידה את המסורת הרוסית של האבירים ההוספיטלרים והכרת המסדר בקרב המסדרים הקיסריים הרוסיים.אבירי הפליטים בסנט פטרסבורג המשיכו לבחור בצאר פאול כמאסטר הגדול שלהם - יריב למאסטר הגדול פון הומפש עד שהתפטרותו של האחרון הותירה את פול כמאסטר הגדול היחיד.המאסטר הגדול פאול הראשון יצר, בנוסף למקדש הרומי-קתולי, "מקדש רוסי גדול" של לא פחות מ-118 קומנדריות, המגמד את שאר חברי המסדר ופתוח לכל הנוצרים.בחירתו של פול למאסטר הגדול מעולם לא אושררה על פי החוק הקנוני הרומי-קתולי, והוא היה המאסטר הגדול של המסדר דה פקטו ולא דה יורה.

בשנת 1834 הקים המסדר, שנודע כמסדר הצבאי הריבוני של מלטה, את מפקדתו בשגרירותו לשעבר ברומא, שם הוא נמצא עד היום.עבודת בית החולים, עבודתו המקורית של המסדר, הפכה שוב לדאגתו העיקרית.פעילויות בית החולים והרווחה של המסדר, שהתבצעו בהיקפים ניכרים במלחמת העולם הראשונה , הועצמו מאוד והורחבו מאוד במלחמת העולם השנייה תחת המאסטר הגדול Fra' Ludovico Chigi Albani della Rovere (המאסטר הגדול 1931–1951).