Kalifati Fatimid , një dinasti shiite isma'ili, ekzistonte nga shekulli i 10-të deri në shekullin e 12-të të erës sonë.Ai u emërua pas Fatimes, vajzës së profetit islamMuhamed , dhe burrit të saj, 'Ali ibn Ebi Talib.Fatimidët u njohën nga komunitete të ndryshme ismaili dhe besime të tjera myslimane.^[87] Sundimi i tyre shtrihej nga Mesdheu perëndimor deri në Detin e Kuq, duke përfshirë Afrikën e Veriut, pjesë të Magrebit, Siçilisë, Levantit dhe Hejazit.Shteti Fatimid u krijua midis viteve 902 dhe 909 të erës sonë nën udhëheqjen e Abu Abdallah.Ai pushtoi Aghlabid Ifriqiya, duke i hapur rrugën Kalifatit.^[88] Abdallah al-Mahdi Billah, i njohur si Imam, u bë Kalif i parë në vitin 909 të es.^[89] Fillimisht, el-Mahdiyya shërbeu si kryeqytet, i themeluar në vitin 921 të erës sonë, më pas u zhvendos në el-Mansuriyya në 948 të erës sonë.Nën sundimin e al-Muizz-it, Egjipti u pushtua në vitin 969 të erës sonë dhe Kajro u vendos si kryeqyteti i ri në 973 të erës sonë.Egjipti u bë zemra kulturore dhe fetare e perandorisë, duke nxitur një kulturë unike arabe.^[90]Kalifati Fatimid ishte i njohur për tolerancën e tij fetare ndaj muslimanëve jo-shiitë, hebrenjve dhe të krishterëve , ^[91] edhe pse ai luftoi për të kthyer popullsinë egjiptiane në besimet e tij.^[92] Gjatë sundimit të al-'Aziz dhe al-Hakim, dhe veçanërisht nën al-Mustansir, Kalifati pa që kalifët të përfshiheshin më pak në çështjet shtetërore, me vezirët që fitonin më shumë pushtet.^[93] Vitet 1060 sollën një luftë civile, e nxitur nga përçarjet politike dhe etnike brenda ushtrisë, duke kërcënuar perandorinë.^[94]Pavarësisht nga një ringjallje e shkurtër nën vezirin Badr al-Jamali, Kalifati Fatimid ra në fund të shekullit të 11-të dhe 12-të, ^[95] u dobësua më tej nga turqit selxhukë në Siri dhe kryqtarët në Levant.^[94] Në vitin 1171 të erës sonë, Saladini shfuqizoi sundimin Fatimid, duke themeluar dinastinë Ejubid dhe duke riintegruar Egjiptin në autoritetin e Kalifatit Abasid .^[96]