تاریخ نظامی یونان در طول جنگ جهانی دوم در 28 اکتبر 1940 آغاز شد، زمانی که ارتش ایتالیا از آلبانی به یونان حمله کرد و جنگ یونان و ایتالیا را آغاز کرد.ارتش یونان به طور موقت تهاجم را متوقف کرد و ایتالیایی ها را به داخل آلبانی برگرداند.موفقیت های یونان ، آلمان نازی را مجبور به مداخله کرد.آلمانی ها در 6 آوریل 1941 به یونان و یوگسلاوی حمله کردند و علیرغم کمک بریتانیا به یونان در قالب یک سپاه اعزامی، ظرف یک ماه بر هر دو کشور تسلط یافتند.فتح یونان در ماه مه با تصرف کرت از هوا تکمیل شد، اگرچه Fallschirmjäger (چتربازان آلمانی) در این عملیات متحمل چنان تلفات گسترده ای شدند که Oberkommando der Wehrmacht (فرماندهی عالی آلمان) عملیات های هوایی در مقیاس بزرگ را برای بقیه رها کرد. از جنگانحراف منابع آلمانی در بالکان نیز به عقیده برخی از مورخان، آغاز تهاجم به اتحاد جماهیر شوروی را تا یک ماه حساس به تأخیر انداخته است، که با شکست ارتش آلمان در تصرف مسکو فاجعه آمیز بود.یونان اشغال شد و بین آلمان،ایتالیا و بلغارستان تقسیم شد، در حالی که پادشاه و دولت بهمصر فرار کردند.اولین تلاش‌ها برای مقاومت مسلحانه در تابستان 1941 توسط قدرت‌های محور سرکوب شد، اما جنبش مقاومت دوباره در سال 1942 آغاز شد و در سال‌های 1943 و 1944 به شدت رشد کرد و بخش‌های زیادی از مناطق کوهستانی کشور را آزاد کرد و نیروهای محور قابل توجهی را به بند کشید.تنش‌های سیاسی بین گروه‌های مقاومت در اواخر سال 1943 در یک درگیری داخلی میان آنها رخ داد که تا بهار 1944 ادامه یافت. شمال آفریقا و ایتالیاکمک نیروی دریایی یونان و دریانوردی تجاری، به ویژه، برای آرمان متفقین اهمیت ویژه ای داشت.سرزمین اصلی یونان در اکتبر 1944 با عقب نشینی آلمان در برابر پیشروی ارتش سرخ آزاد شد، در حالی که پادگان های آلمانی تا پایان جنگ در جزایر دریای اژه باقی ماندند.کشور در اثر جنگ و اشغال ویران شده بود و اقتصاد و زیرساخت های آن ویران شده بود.در سال 1946، جنگ داخلی بین دولت محافظه کار تحت حمایت خارجی و چریک های چپ آغاز شد که تا سال 1949 ادامه داشت.