Ağa Muhammed Han, son Zand kralının ölümünün ardından iç savaştan zaferle çıktıktan sonra İran'ı yeniden birleştirmeye ve merkezileştirmeye odaklandı.^[54] Nader Şah sonrası ve Zand döneminde İran'ın Kafkasya topraklarında çeşitli hanlıklar oluşmuştu.Ağa Muhammed Han, bu bölgeleri herhangi bir ana kara bölgesi kadar ayrılmaz kabul ederek İran'a yeniden dahil etmeyi amaçladı.Başlıca hedeflerinden biri, İran'ın egemenliği açısından hayati önemde gördüğü Gürcistan'dı.Gürcü kralı II. Erekle'nin Rusya ile 1783'te yaptığı anlaşmadan vazgeçmesini ve II. Erekle'nin reddettiği Pers hükümdarlığını yeniden kabul etmesini talep etti.Buna cevaben Ağa Muhammed Han askeri bir harekat başlattı ve İran'ın günümüz Ermenistanı , Azerbaycan , Dağıstan ve Iğdır da dahil olmak üzere çeşitli Kafkasya toprakları üzerindeki kontrolünü başarılı bir şekilde yeniden tesis etti.Krtsanisi Muharebesi'nde zafer kazanarak Tiflis'in ele geçirilmesine ve Gürcistan'ın fiilen yeniden zapt edilmesine yol açtı.^[55]Ağa Muhammed Han, 1796'da Gürcistan'daki başarılı seferinden döndükten ve binlerce Gürcü esiri İran'a naklettikten sonra resmen Şah olarak taç giydi.Saltanatı, 1797'de Gürcistan'a karşı başka bir sefer planlarken bir suikastla yarıda kesildi.Onun ölümünün ardından Rusya bölgesel istikrarsızlıktan yararlandı.1799'da Rus kuvvetleri Tiflis'e girdi ve 1801'de Gürcistan'ı fiilen ilhak ettiler.Bu genişleme Rus-İran Savaşlarının (1804-1813 ve 1826-1828) başlangıcı oldu ve Gülistan ve Türkmençay Antlaşmaları'nda belirtildiği gibi Doğu Gürcistan, Dağıstan, Ermenistan ve Azerbaycan'ın Rusya'ya bırakılmasına yol açtı.Böylece Aras Nehri'nin kuzeyindeki günümüz Azerbaycan'ı, doğu Gürcistan'ı, Dağıstan'ı ve Ermenistan'ı da içeren topraklar, 19. yüzyılda Rusya tarafından işgal edilene kadar İran'ın bir parçası olarak kaldı.^[56]Rus-Pers Savaşları ve Kafkasya'daki geniş toprakların resmi olarak kaybedilmesinin ardından önemli demografik değişimler meydana geldi.1804-1814 ve 1826-1828 savaşları, Kafkas Muhacirleri olarak bilinen İran ana karasına büyük göçlere yol açtı.Bu hareket Ayrumlar, Karapapaqlar, Çerkesler, Şii Lezgiler ve diğer Transkafkasya Müslümanları gibi çeşitli etnik grupları içeriyordu.^[57] 1804'teki Gence Muharebesi'nden sonra birçok Ayrum ve Karapapaq İran'ın Tebriz şehrine yerleştirildi.1804-1813 savaşı boyunca ve daha sonra 1826-1828 çatışması sırasında, yeni fethedilen Rus topraklarından bu grupların çoğu, günümüzün Batı Azerbaycan eyaleti olan İran'daki Solduz'a göç etti.^[58] Rusya'nın Kafkasya'daki askeri faaliyetleri ve yönetim sorunları, çok sayıda Müslümanın ve bazı Gürcü Hıristiyanların İran'a sürgüne gönderilmesine neden oldu.^[59]1864'ten 20. yüzyılın başlarına kadar, Rusya'nın Kafkas Savaşı'ndaki zaferinin ardından başka sınır dışı edilmeler ve gönüllü göçler meydana geldi.Bu, Azerbaycanlılar, diğer Transkafkasya Müslümanları ve Çerkesler, Şii Lezginler ve Laklar gibi Kuzey Kafkasyalı grupların da dahil olduğu Kafkas Müslümanlarının İran ve Türkiye'ye doğru ek hareketlerine yol açtı.^[57] Bu göçmenlerin çoğu, 19. yüzyılın sonlarında kurulan Pers Kazak Tugayı'nın önemli bir bölümünü oluşturarak İran tarihinde önemli roller oynadı.^[60]1828 Türkmençay Antlaşması, Ermenilerin İran'dan yeni Rusya kontrolündeki bölgelere yerleştirilmesini de kolaylaştırdı.^[61] Tarihsel olarak Ermeniler Doğu Ermenistan'da çoğunluktaydı ancak Timur'un seferleri ve ardından gelen İslami hakimiyet sonrasında azınlık haline geldiler.^[62] Rusya'nın İran'ı işgali etnik yapıyı daha da değiştirerek 1832'de Doğu Ermenistan'da Ermeni çoğunluğunun oluşmasına yol açtı. Bu demografik değişim, Kırım Savaşı ve 1877-1878 Rus-Türk Savaşı'ndan sonra daha da sağlamlaştı.^[63]Bu dönemde İran, Feth Ali Şah yönetimi altında Batı'nın diplomatik katılımının arttığını deneyimledi.Rusya'dan etkilenen torunu Muhammed Şah Kaçar, Herat'ı ele geçirmeye çalıştı ancak başarısız oldu.Muhammed Şah'tan sonra gelen Nasereddin Şah Kaçar daha başarılı bir hükümdardı ve İran'ın ilk modern hastanesini kurdu.^[64]1870-1871 Büyük Pers Kıtlığı, yaklaşık iki milyon insanın ölümüyle sonuçlanan felaket bir olaydı.^[65] Bu dönem, Pers tarihinde önemli bir geçişe işaret ediyordu ve 19. yüzyılın sonlarında ve 20. yüzyılın başlarında Şah'a karşı İran Meşrutiyet Devrimi'ne yol açtı.Zorluklara rağmen Şah, 1906'da sınırlı bir anayasayı kabul ederek İran'ı anayasal monarşiye dönüştürdü ve 7 Ekim 1906'da ilk Meclisin (parlamento) toplanmasına yol açtı.1908'de İngilizler tarafından Khuzestan'da petrolün keşfedilmesi, özellikle Britanya İmparatorluğu'nun (William Knox D'Arcy ve şimdiki BP olan Anglo-İran Petrol Şirketi ile bağlantılı) İran'daki yabancı çıkarlarını yoğunlaştırdı.Bu döneme aynı zamanda Büyük Oyun olarak bilinen, İngiltere ile Rusya arasında İran konusunda yaşanan jeopolitik rekabet de damgasını vurdu.1907 İngiliz-Rus Konvansiyonu, İran'ı nüfuz alanlarına bölerek ulusal egemenliğini baltaladı.Birinci Dünya Savaşı sırasında İran, İngiliz, Osmanlı ve Rus kuvvetleri tarafından işgal edildi ancak büyük ölçüde tarafsız kaldı.Birinci Dünya Savaşı ve Rus Devrimi sonrası Britanya, İran üzerinde bir himaye kurmaya çalıştı ama sonuçta başarısız oldu.Gilan'ın Meşrutiyet hareketi ve Kaçar hükümetinin zayıflamasıyla vurgulanan İran'daki istikrarsızlık, Rıza Han'ın, daha sonra Rıza Şah Pehlevi'nin yükselişine ve 1925'te Pehlevi hanedanının kurulmasına yol açtı. İran Kazak Tugayı'ndan Rıza Han ve Seyyed Zia'eddin Tabatabai tarafından başlatılan bu girişim, başlangıçta Kaçar monarşisini doğrudan devirmek yerine hükümet yetkililerini kontrol etmeyi amaçlıyordu.Rıza Han'ın etkisi arttı ve ^[1925'te] başbakanlık yaptıktan sonra Pehlevi hanedanının ilk Şahı oldu.