W latach 1241–1242 królestwo doznało poważnego ciosu w następstwie najazdu Mongołów na Europę.Po najeździe Mongołów na Węgry w 1241 r. armia węgierska została katastrofalnie pokonana w bitwie pod Mohi.Król Béla IV uciekł z pola bitwy, a następnie z kraju po tym, jak Mongołowie ścigali go aż do jego granic.Zanim Mongołowie się wycofali, zginęła duża część populacji (20–50%).^[22] Na równinach zniszczono od 50 do 80% osad.^[23] Natarcie mogły wytrzymać jedynie zamki, silnie ufortyfikowane miasta i opactwa, gdyż Mongołowie nie mieli czasu na długie oblężenia – ich celem było jak najszybsze przedostanie się na zachód.Machiny oblężnicze oraz inżynierowiechińscy i perscy, którzy obsługiwali je dla Mongołów, pozostały na podbitych ziemiach Rusi Kijowskiej.^[24] Zniszczenia spowodowane najazdami mongolskimi doprowadziły później do zaproszenia osadników z innych części Europy, zwłaszcza z Niemiec.Podczas kampanii Mongołów przeciwko Rusi Kijowskiej około 40 000 Kumanów , członków koczowniczego plemienia pogańskich Kipczaków, zostało wypędzonych na zachód od Karpat.^[25] Tam Kumanie zwrócili się o ochronę do króla Béli IV.^[26] Irański lud Jassic przybył na Węgry wraz z Kumanami po ich pokonaniu przez Mongołów.Kumanie stanowili być może aż 7–8% ludności Węgier w drugiej połowie XIII wieku.^[27] Na przestrzeni wieków zostali oni w pełni zasymilowani przez ludność węgierską, a ich język zanikł, zachowali jednak swoją tożsamość i autonomię regionalną aż do 1876 roku. ^[28]W wyniku najazdów mongolskich król Béla nakazał budowę setek kamiennych zamków i fortyfikacji, aby pomóc w obronie przed możliwą drugą inwazją mongolską.Mongołowie rzeczywiście powrócili na Węgry w 1286 r., ale powstrzymały ich nowo wybudowane systemy zamków kamiennych i nowa taktyka wojskowa obejmująca większy odsetek ciężko uzbrojonych rycerzy.Najeżdżające siły mongolskie zostały pokonane pod Pesztem przez armię królewską króla Władysława IV.Późniejsze najazdy również zostały z łatwością odparte.Zamki zbudowane przez Bélę IV okazały się w późniejszym czasie bardzo przydatne w długiej walce z Imperium Osmańskim .Koszty ich budowy jednak zadłużyły króla węgierskiego u głównych posiadaczy feudalnych, tak że władza królewska odzyskana przez Bélę IV po znacznym osłabieniu jego ojca Andrzeja II została ponownie rozproszona wśród mniejszej szlachty.