In 1241–1242 kreeg het koninkrijk een grote klap te verwerken in de nasleep van de Mongoolse invasie van Europa.Nadat Hongarije in 1241 door de Mongolen was binnengevallen, werd het Hongaarse leger op rampzalige wijze verslagen in de Slag bij Mohi.Koning Béla IV ontvluchtte het slagveld en vervolgens het land nadat de Mongolen hem tot aan de grenzen achtervolgden.Voordat de Mongolen zich terugtrokken, stierf een groot deel van de bevolking (20-50%).^[22] In de vlakten werd tussen de 50 en 80% van de nederzettingen verwoest.^[23] Alleen kastelen, sterk versterkte steden en abdijen konden de aanval weerstaan, aangezien de Mongolen geen tijd hadden voor langdurige belegeringen - hun doel was om zo snel mogelijk naar het westen te trekken.De belegeringsmachines en deChinese en Perzische ingenieurs die ze voor de Mongolen bedienden, waren achtergelaten in de veroverde landen van Kievan Rus.^[24] De verwoesting veroorzaakt door de Mongoolse invasies leidde later tot de uitnodiging van kolonisten uit andere delen van Europa, vooral uit Duitsland.Tijdens de campagne van de Mongolen tegen het Kievse Rijk werden zo'n 40.000 Cumans , leden van een nomadische stam van heidense Kipchaks, ten westen van de Karpaten verdreven.^[25] Daar deden de Cumans een beroep op koning Béla IV voor bescherming.^[26] Het Iraanse Jassic-volk kwam samen met de Cumans naar Hongarije nadat ze waren verslagen door de Mongolen.Cumans vormden in de tweede helft van de 13e eeuw misschien wel 7 à 8% van de bevolking van Hongarije.^[27] Door de eeuwen heen werden ze volledig opgenomen in de Hongaarse bevolking, en hun taal verdween, maar ze behielden hun identiteit en hun regionale autonomie tot 1876. ^[28]Als gevolg van de Mongoolse invasies gaf koning Béla opdracht tot de bouw van honderden stenen kastelen en vestingwerken ter verdediging tegen een mogelijke tweede Mongoolse invasie.De Mongolen keerden inderdaad in 1286 terug naar Hongarije, maar de nieuw gebouwde stenen kasteelsystemen en nieuwe militaire tactieken waarbij een groter aantal zwaarbewapende ridders betrokken waren, hielden hen tegen.De binnenvallende Mongoolse strijdmacht werd nabij Pest verslagen door het koninklijke leger van koning Ladislaus IV.Ook latere invasies werden handig afgeslagen.De door Béla IV gebouwde kastelen bleken later zeer nuttig in de lange strijd tegen het Ottomaanse Rijk .De kosten van de bouw ervan waren de Hongaarse koning echter verschuldigd aan de belangrijkste feodale landheren, zodat de koninklijke macht die door Béla IV werd teruggewonnen nadat zijn vader Andreas II aanzienlijk was verzwakt, opnieuw onder de lagere adel werd verspreid.