1941 թվականի դեկտեմբերին Խաղաղ օվկիանոսում պատերազմի բռնկումը Մալայայում բրիտանացիներին բոլորովին անպատրաստ գտավ։1930-ական թվականներին, ակնկալելով ճապոնական ռազմածովային ուժերի աճող սպառնալիքը, նրանք Սինգապուրում կառուցեցին մեծ ռազմածովային բազա, բայց երբեք չէին ակնկալում հյուսիսից Մալայա ներխուժում:Հեռավոր Արևելքում բրիտանական օդային հզորություն գրեթե չկար:Այսպիսով,ճապոնացիները կարողացան անպատիժ հարձակվել ֆրանսիական հնդկական Չինաստանի իրենց բազաներից և չնայած բրիտանական, ավստրալական ևհնդկական ուժերի դիմադրությանը, նրանք երկու ամսում գրավեցին Մալայան:Սինգապուրը, առանց ցամաքային պաշտպանության, առանց օդային ծածկույթի և ջրամատակարարման, ստիպված եղավ հանձնվել 1942 թվականի փետրվարին: Բրիտանական Հյուսիսային Բորնեոն և Բրունեյը նույնպես օկուպացված էին:Ճապոնական գաղութային կառավարությունը մալայացիներին դիտարկում էր համաասիական տեսանկյունից և խթանում էր մալայական ազգայնականության սահմանափակ ձևը:Մալայական ազգայնական Կեսաթուան Մելայու Մուդան, Մելայու Ռայայի պաշտպանները, համագործակցում էին ճապոնացիների հետ՝ հիմնվելով այն ըմբռնման վրա, որ Ճապոնիան կմիավորի հոլանդական Արևելյան Հնդկաստանը, Մալայան և Բորնեոն և նրանց անկախություն կշնորհի:^[80] Օկուպանտներըչինացիներին , սակայն, համարում էին թշնամի այլմոլորակայիններ և նրանց հետ վարվում էին մեծ կոշտությամբ. այսպես կոչված սուկ-չինգի ժամանակ (տառապանքի միջոցով մաքրում), Մալայայում և Սինգապուրում սպանվեցին մինչև 80000 չինացիներ։Չինացիները՝ Մալայան կոմունիստական ​​կուսակցության (ՄԿԿ) գլխավորությամբ, դարձան Մալայական ժողովրդական հակաճապոնական բանակի (MPAJA) ողնաշարը։Բրիտանական աջակցությամբ MPAJA-ն դարձավ օկուպացված ասիական երկրներում ամենաարդյունավետ դիմադրության ուժը:Չնայած ճապոնացիները պնդում էին, որ իրենք աջակցում են մալայական ազգայնականությանը, նրանք վիրավորեցին մալայական ազգայնականությունը՝ թույլ տալով իրենց դաշնակից Թաիլանդին վերամիավորել հյուսիսային չորս նահանգները՝ Կեդահը, Պերլիսը, Քելանտանը և Տերենգանուն, որոնք տեղափոխվել էին բրիտանական Մալայա 1909 թվականին: Մալայայի կորուստը: Արտահանման շուկաները շուտով հանգեցրին զանգվածային գործազրկության, որն ազդեց բոլոր ռասաների վրա և ճապոնացիներին դարձրեց ավելի անժողովրդական:^[81]