Το Χαλιφάτο των Φατιμιδών , μια σιιτική δυναστεία Ισμαϊλί, υπήρχε από τον 10ο έως τον 12ο αιώνα μ.Χ.Πήρε το όνομά του από τη Φατίμα, κόρη του ισλαμικού προφήτηΜωάμεθ , και του συζύγου της, Αλί ιμπν Αμπι Ταλίμπ.Οι Φατιμίδες αναγνωρίστηκαν από διάφορες κοινότητες Ισμαϊλί και άλλα μουσουλμανικά δόγματα.^[87] Η κυριαρχία τους εκτεινόταν από τη δυτική Μεσόγειο έως την Ερυθρά Θάλασσα, συμπεριλαμβανομένης της Βόρειας Αφρικής, μέρη του Μαγκρέμπ, της Σικελίας, του Λεβάντε και της Χετζάζ.Το κράτος των Φατιμιδών ιδρύθηκε μεταξύ 902 και 909 CE υπό την ηγεσία του Abu Abdallah.Κατέκτησε την Aghlabid Ifriqiya, ανοίγοντας το δρόμο για το Χαλιφάτο.^[88] Ο Abdallah al-Mahdi Billah, αναγνωρισμένος ως Ιμάμης, έγινε ο πρώτος Χαλίφης το 909 Κ.Χ.^[89] Αρχικά, η al-Mahdiyya χρησίμευσε ως πρωτεύουσα, που ιδρύθηκε το 921 CE, στη συνέχεια μετακόμισε στην al-Mansuriyya το 948 CE.Υπό τη βασιλεία του al-Mu'izz, η Αίγυπτος κατακτήθηκε το 969 Κ.Χ., και το Κάιρο καθιερώθηκε ως νέα πρωτεύουσα το 973 Κ.Χ.Η Αίγυπτος έγινε η πολιτιστική και θρησκευτική καρδιά της αυτοκρατορίας, καλλιεργώντας έναν μοναδικό αραβικό πολιτισμό.^[90]Το Χαλιφάτο των Φατιμιδών ήταν γνωστό για τη θρησκευτική του ανοχή προς τους μη Σιίτες Μουσουλμάνους, Εβραίους και Χριστιανούς , ^[91] αν και πάλευε να προσηλυτίσει τον αιγυπτιακό πληθυσμό στις πεποιθήσεις του.^[92] Κατά τη διάρκεια της βασιλείας του al-Aziz και του al-Hakim, και ιδιαίτερα υπό τον al-Mustansir, το Χαλιφάτο είδε τους χαλίφηδες να εμπλέκονται λιγότερο στις κρατικές υποθέσεις, με τους βεζίρηδες να αποκτούν περισσότερη δύναμη.^[93] Η δεκαετία του 1060 έφερε έναν εμφύλιο πόλεμο, που τροφοδοτήθηκε από πολιτικές και εθνοτικές διαιρέσεις εντός του στρατού, απειλώντας την αυτοκρατορία.^[94]Παρά τη σύντομη αναβίωση υπό τον βεζίρη Μπαντρ αλ-Τζαμαλί, το Χαλιφάτο των Φατιμιδών παρήκμασε στα τέλη του 11ου και 12ου αιώνα, ^[95] αποδυναμώθηκε περαιτέρω από τους Σελτζούκους Τούρκους στη Συρία και τους Σταυροφόρους στο Λεβάντε.^[94] Το 1171 Κ.Χ., ο Σαλαντίν κατάργησε την κυριαρχία των Φατιμιδών, ιδρύοντας τη δυναστεία των Αγιουβιδών και επανενσωματώνοντας την Αίγυπτο στην εξουσία του Χαλιφάτου των Αββασιδών .^[96]