1958 میں پاکستان کا پارلیمانی نظام مارشل لاء کے نفاذ کے ساتھ ختم ہوا۔سول بیوروکریسی اور انتظامیہ میں بدعنوانی سے عوامی مایوسی جنرل ایوب خان کے اقدامات کی حمایت کا باعث بنی۔^[16] فوجی حکومت نے اہم زمینی اصلاحات کیں اور ایچ ایس سہروردی کو عوامی عہدے سے روکتے ہوئے، انتخابی اداروں کی نااہلی کا حکم نافذ کیا۔خان نے "بنیادی جمہوریت" متعارف کرایا، ایک نیا صدارتی نظام جہاں 80,000 کے الیکٹورل کالج نے صدر کا انتخاب کیا، اور 1962 کے آئین کو جاری کیا۔^[17] 1960 میں، ایوب خان نے ایک قومی ریفرنڈم میں عوامی حمایت حاصل کی، جس میں فوج سے آئینی سویلین حکومت میں تبدیلی ہوئی۔^[16]ایوب خان کے دور صدارت میں اہم پیش رفتوں میں دارالحکومت کے بنیادی ڈھانچے کو کراچی سے اسلام آباد منتقل کرنا شامل تھا۔یہ دور، جسے "عظیم دہائی" کے نام سے جانا جاتا ہے، اس کی اقتصادی ترقی اور ثقافتی تبدیلیوں کے لیے منایا جاتا ہے، ^[18] جس میں پاپ میوزک، فلم اور ڈرامہ کی صنعتوں کا عروج بھی شامل ہے۔ایوب خان نے سنٹرل ٹریٹی آرگنائزیشن (CENTO) اور جنوب مشرقی ایشیا ٹریٹی آرگنائزیشن (SEATO) میں شمولیت اختیار کرتے ہوئے پاکستان کو امریکہ اور مغربی دنیا کے ساتھ جوڑ دیا۔پرائیویٹ سیکٹر میں اضافہ ہوا، اور ملک نے تعلیم، انسانی ترقی اور سائنس میں پیش رفت کی، بشمول خلائی پروگرام شروع کرنا اور جوہری توانائی کے پروگرام کو جاری رکھنا۔^[18]تاہم، 1960 میں U2 جاسوس طیارے کے واقعے نے پاکستان سے خفیہ امریکی کارروائیوں کو بے نقاب کیا، جس سے قومی سلامتی سے سمجھوتہ کیا گیا۔اسی سال پاکستان نے تعلقات کو معمول پر لانے کے لیے بھارت کے ساتھ سندھ طاس معاہدے پر دستخط کیے تھے۔^[19] چین کے ساتھ تعلقات مضبوط ہوئے، خاص طور پر چین بھارت جنگ کے بعد، جس کے نتیجے میں 1963 میں ایک سرحدی معاہدہ ہوا جس نے سرد جنگ کی حرکیات کو بدل دیا۔1964 میں، پاکستانی مسلح افواج نے مغربی پاکستان میں ایک مشتبہ پرو کمیونسٹ بغاوت کو کچل دیا، اور 1965 میں، ایوب خان نے فاطمہ جناح کے خلاف متنازعہ صدارتی انتخابات میں کامیابی حاصل کی۔