Un studiu al geneticii asiatice sugerează că oamenii originari din Asia de Est provin din Asia de Sud-Est.^[14] Grupurile indigene din peninsulă pot fi împărțite în trei etnii: Negritos, Senoi și proto-malaezii.^[15] Primii locuitori ai Peninsulei Malaeze au fost cel mai probabil Negritos.^[16] Acești vânători mezolitici au fost probabil strămoșii Semang, un grup etnic Negrito.^[17] Senoi par a fi un grup compus, cu aproximativ jumătate din liniile de ADN mitocondrial matern urmărind înapoi la strămoșii Semang și aproximativ jumătate până la migrațiile ancestrale ulterioare din Indochina.Cercetătorii sugerează că sunt descendenți ai agricultorilor timpurii vorbitori de austroasiatică, care și-au adus atât limba, cât și tehnologia în partea de sud a peninsulei cu aproximativ 4.000 de ani în urmă.S-au unit și s-au unit cu populația indigenă.^[18] Proto Malays au o origine mai diversă ^[19] și s-au stabilit în Malaezia până în anul 1000 î.Hr. ca urmare a expansiunii austroneziene.^[20] Deși arată unele legături cu alți locuitori din Asia de Sud-Est Maritim, unii au, de asemenea, un ascendent în Indochina în jurul perioadei Ultimul Maxim glaciar, acum aproximativ 20.000 de ani.Zonele care cuprind ceea ce este acum Malaezia au participat la Maritime Jade Road.Rețeaua comercială a existat timp de 3.000 de ani, între 2000 î.Hr. și 1000 EC.^[21]Antropologii susțin ideea că proto-malaezii provin din ceea ce este astăzi Yunnan,China .^[22] Aceasta a fost urmată de o dispersie timpurie a Holocenului prin Peninsula Malaeză în Arhipelagul Malay.^[23] În jurul anului 300 î.Hr., au fost împinși în interior de deutero-malezii, un popor din epoca fierului sau epoca bronzului descins parțial din Chams din Cambodgia și Vietnam .Primul grup din peninsulă care a folosit unelte metalice, deutero-malezii au fost strămoșii direcți ai malaysianilor de astăzi și au adus cu ei tehnici agricole avansate.^[17] Malaezii au rămas fragmentați din punct de vedere politic pe tot arhipelagul Malay, deși au fost împărtășite o cultură și o structură socială comune.^[24]