Tussen 1258 en 1291 werd de regio geconfronteerd met onrust als grens tussen Mongoolse indringers , af en toe verbonden met kruisvaarders , en deMamelukken vanEgypte .Dit conflict leidde tot een aanzienlijke bevolkingsvermindering en economische tegenspoed.De Mamelukken waren grotendeels van Turkse afkomst en werden als kinderen gekocht en vervolgens getraind in oorlogsvoering.Het waren zeer gewaardeerde krijgers, die de heersers onafhankelijkheid gaven van de inheemse aristocratie.In Egypte namen ze de controle over het koninkrijk over na een mislukte invasie door de kruisvaarders (Zevende Kruistocht).De Mamelukken namen de controle over Egypte over en breidden hun heerschappij uit naar Palestina.De eerste Mamelukken-sultan, Qutuz, versloeg de Mongolen in de Slag bij Ain Jalut, maar werd vermoord door Baibars, die hem opvolgde en de meeste buitenposten van de kruisvaarders uitschakelde.De Mamelukken regeerden over Palestina tot 1516 en beschouwden het als onderdeel van Syrië.In Hebron werden joden geconfronteerd met beperkingen bij de Grot van de Patriarchen, een belangrijke plaats in het jodendom, een beperking die bleef bestaan ​​tot aan de Zesdaagse Oorlog.^[146]Al-Ashraf Khalil, een Mamelukken-sultan, veroverde het laatste bolwerk van de kruisvaarders in 1291. De Mamelukken, die het Ayyubid-beleid voortzetten, vernietigden strategisch kustgebieden van Tyrus tot Gaza om mogelijke zee-aanvallen van de kruisvaarders te voorkomen.Deze verwoesting leidde tot langdurige ontvolking en economische achteruitgang in deze gebieden.^[147]De Joodse gemeenschap in Palestina zag een verjonging door de toestroom van Sefardische Joden na hun verdrijving uitSpanje in 1492 en de vervolging in Portugal in 1497. Onder Mamelukken en later Ottomaanse overheersing vestigden deze Sefardische Joden zich voornamelijk in stedelijke gebieden als Safed en Jeruzalem, in tegenstelling tot de Joodse gemeenschap in Palestina. voornamelijk landelijke Musta'arbi Joodse gemeenschap.^[148]