A francia-thai háború befejezése után a thai kormány semlegességet hirdetett.Amikor 1941. december 8-án ajapánok megszállták Thaiföldet, néhány órával a Pearl Harbor elleni támadás után, Japán jogot követelt arra, hogy csapatokat mozgasson Thaiföldön a maláj határig.Phibun rövid ellenállás után elfogadta a japán követeléseket.A kormány javította kapcsolatait Japánnal azáltal, hogy 1941 decemberében katonai szövetséget írt alá. A japán hadseregek bázisként használták az országot burmai és malájai invázióikhoz.^[63] A tétovázás azonban átadta helyét a lelkesedésnek, miután a japánok meglepően csekély ellenállással átgördültek Malayán egy „Bicycle Blitzkrieg”-ben.^[64] A következő hónapban Phibun hadat üzent Nagy-Britanniának és az Egyesült Államoknak .Dél-Afrika és Új-Zéland ugyanazon a napon hadat üzent Thaiföldnek.Nem sokkal ezután Ausztrália következett.^[65] Mindazokat, akik ellenezték a japán szövetséget, elbocsátották kormányától.Pridi Phanomyongot a távollévő Ananda Mahidol király megbízott régensévé nevezték ki, míg Direk Jayanamát, a prominens külügyminisztert, aki a japánokkal szembeni folyamatos ellenállást hirdette, később Tokióba küldték nagykövetnek.Az Egyesült Államok Thaiföldet Japán bábjának tekintette, és nem volt hajlandó háborút üzenni.Amikor a szövetségesek győzedelmeskedtek, az Egyesült Államok blokkolta a brit erőfeszítéseket a büntető béke kikényszerítésére.^[66]A thaiak és a japánok megegyeztek abban, hogy Shan állam és Kayah állam thai irányítás alá kerül.1942. május 10-én a thai phayap hadsereg belépett Burma keleti Shan államába, a thai burmai térség hadserege pedig Kayah államba és Burma középső részének egyes részeibe.Három thaiföldi gyalogos és egy lovas hadosztály, páncélos felderítő csoportok élén és a légierő támogatásával harcolt a visszavonuló kínai 93. hadosztály ellen.Kengtungot, a fő célpontot május 27-én fogták el.A júniusban és novemberben megújított offenzívák következtében a kínaiak visszavonultak Jünnanba.^[67] A Shan államokat és Kayah államot magában foglaló területet 1942-ben csatolta Thaiföldhöz. 1945-ben adják vissza Burmának.A Seri Thai (Szabad Thai Mozgalom) egy Japán elleni földalatti ellenállási mozgalom, amelyet Seni Pramoj, thaiföldi washingtoni nagykövet alapított.Thaiföldről, Pridi régens hivatalától vezetve, szabadon működött, gyakran a királyi család tagjai, például Chula Chakrabongse herceg és a kormány tagjai támogatásával.Ahogy Japán közeledett a vereséghez, és a földalatti japán-ellenes ellenállás, a Seri Thai folyamatosan erősödött, a Nemzetgyűlés kikényszerítette Phibunt.Hat éves katonai főparancsnoki uralkodása véget ért.Lemondását részben két félresikerült grandiózus terve kényszerítette ki.Az egyik a főváros áthelyezése Bangkokból egy távoli helyre a dzsungelben, Phetchabun közelében, Thaiföld észak-középső részén.A másik egy "buddhista város" felépítése volt Saraburi közelében.A súlyos gazdasági nehézségek idején bejelentett ötletek sok kormánytisztet ellene fordítottak.^[68]A háború végén Phibunt a szövetségesek ragaszkodására bíróság elé állították háborús bűnök elkövetésével, elsősorban a tengelyhatalmakkal való együttműködés vádjával.A közvélemény heves nyomása közepette azonban felmentették.A közvélemény továbbra is kedvező volt Phibunnak, mivel úgy gondolták, hogy mindent megtett a thaiföldi érdekek védelmében, konkrétan a Japánnal kötött szövetség segítségével támogassa a thai terület kiterjesztését Malayában és Burmában.^[69]