Dinastija Safavida , koja je vladala od 1501. do 1722. s kratkom obnovom od 1729. do 1736., često se smatra početkom moderne perzijske povijesti.Uspostavili su dvanaestorsku školu šiitskog islama kao državnu religiju, ključni događaj u muslimanskoj povijesti.Na svom vrhuncu, Safavidi su kontrolirali moderni Iran, Azerbajdžan , Armeniju , Gruziju , dijelove Kavkaza, Irak , Kuvajt, Afganistan i dijelove Turske , Sirije, Pakistana , Turkmenistana i Uzbekistana, što ih je činilo jednim od glavnih islamskih "baruta". carstva" uz Osmansko i Mogulsko carstvo.^[44]Utemeljena od strane Ismāila I, koji je postao šah Ismāil ^[45] nakon zauzimanja Tabriza 1501., dinastija Safavida izašla je kao pobjednik u borbi za vlast koja je uslijedila u Perziji nakon raspada Kara Koyunlua i Aq Qoyunlua.Ismāil je brzo učvrstio svoju vlast nad cijelom Perzijom.Safavidsko doba doživjelo je značajan administrativni, kulturni i vojni razvoj.Vladari dinastije, posebice šah Abbas I., proveli su značajne vojne reforme uz pomoć europskih stručnjaka poput Roberta Shirleya, ojačali su trgovačke veze s europskim silama i revitalizirali perzijsku arhitekturu i kulturu.Šah Abas I. je također slijedio politiku deportacije i preseljenja velikog broja Čerkeza, Gruzijaca i Armenaca unutar Irana, dijelom kako bi smanjio moć plemenske elite Qizilbash.^[46]Međutim, mnogi safavidski vladari nakon Abbasa I. bili su manje učinkoviti, prepustili su se ležernim aktivnostima i zanemarivali državne poslove, što je dovelo do pada dinastije.Ovaj pad je pogoršan vanjskim pritiscima, uključujući napade susjednih sila.Godine 1722. Mir Wais Khan, poglavica Ghilzai Paštuna, pobunio se u Kandaharu, a Petar Veliki iz Rusije iskoristio je kaos da bi zauzeo perzijske teritorije.Afganistanska vojska, predvođena Mahmudom, Mir Waisovim sinom, zauzela je Isfahan i proglasila novu vlast.Safavidska dinastija zapravo je okončana usred tih previranja, a 1724. godine iranski teritoriji su podijeljeni između Osmanlija i Rusa prema Carigradskom sporazumu.^[47] Iranski suvremeni šijitski karakter i značajni segmenti iranskih sadašnjih granica potječu iz ovog doba.Prije uspona Safavidskog carstva, sunitski islam je bio dominantna religija, koja je u to vrijeme činila oko 90% stanovništva.^[53] Tijekom 10. i 11. stoljeća, Fatimidi su poslali Ismailis Da'i (misionare) u Iran, kao iu druge muslimanske zemlje.Kada su se ismailiti podijelili u dvije sekte, nizari su uspostavili svoju bazu u Iranu.Nakon napada Mongola 1256. i pada Abasida, sunitske hijerarhije su se poljuljale.Ne samo da su izgubili hilafet nego i status službenog mezheba.Njihov gubitak bio je dobitak šiita, čije središte u to vrijeme nije bilo u Iranu.Glavna promjena dogodila se početkom 16. stoljeća, kada je Ismail I. utemeljio dinastiju Safavida i pokrenuo vjersku politiku priznavanja šiitskog islama kao službene religije Safavidskog carstva, a činjenica da moderni Iran ostaje službeno šiitski to stanje izravna je posljedica Ismailovih postupaka.Prema Mortazi Motahhariju, većina iranskih učenjaka i masa ostali su suniti sve do vremena Safavida.