תקופת שלטון תחת בית ואסה השוודי החלה במדינות חבר העמים בשנת 1587. שני המלכים הראשונים משושלת זו, זיגיסמונד השלישי (1587–1632) וולדיסלב הרביעי (1632–1648), ניסו שוב ושוב תככים להצטרפות לכס המלכות של שוודיה, שהיווה מקור מתמיד להסחת דעת לענייני חבר העמים.באותה תקופה, הכנסייה הקתולית יצאה למתקפת נגד אידיאולוגית והקונטרפורמציה טענה שחוזרים בתשובה רבים מחוגים פרוטסטנטיים פולניים וליטאים.בשנת 1596, איחוד ברסט פיצל את הנוצרים המזרחיים של חבר העמים כדי ליצור את הכנסייה המאוחדת של הטקס המזרחי, אך בכפוף לסמכות האפיפיור.מרד זבז'ידובסקי נגד זיגיסמונד השלישי התפתח בשנים 1606–1608.בחיפוש אחר עליונות במזרח אירופה, חבר העמים נלחם במלחמות עם רוסיה בין 1605 ל-1618 בעקבות תקופת הצרות של רוסיה;סדרת הסכסוכים מכונה המלחמה הפולנית-מוסקובית או הדימיטריאדים.המאמצים הביאו להרחבת השטחים המזרחיים של חבר העמים הפולני-ליטאי, אך המטרה להשתלט על כס המלכות הרוסי עבור השושלת הפולנית לא הושגה.שבדיה חיפשה את עליונות הים הבלטי במהלך מלחמות פולין-שוודיה בשנים 1617–1629, והאימפריה העות'מאנית לחצה מדרום בקרבות בצ'קורה ב-1620 ובחוטין ב-1621. ההתרחבות החקלאית ומדיניות הצמיתות באוקראינה הפולנית הביאו לסדרה של מרידות קוזקים .חבר העמים, שהיה בעל ברית עם המלוכה ההבסבורגית, לא השתתף ישירות במלחמתשלושים השנים. שלטונו הרביעי של ולדיסלב היה ברובו שליו, כאשר פלישה רוסית בדמות מלחמת סמולנסק בשנים 1632–1634 נהדפה בהצלחה.היררכיית הכנסייה האורתודוקסית, שנאסרה בפולין לאחר איחוד ברסט, הוקמה מחדש ב-1635.