מהמאות ה-5 עד ה-13, דרום מזרח אסיה ראתה שורה של מדינות חזקות שהיו פעילות מאוד בקידום הבודהיזם והאמנות הבודהיסטית לצד
ההינדואיזם .ההשפעה הבודהיסטית העיקרית הגיעה כעת ישירות דרך הים מתת היבשת ההודית, כך שהאימפריות הללו עקבו בעצם אחר אמונת המהאיאנה.דוגמאות כוללות ממלכות יבשתיות כמו פונן,
אימפריית החמר והממלכה
התאילנדית סוקוטאי וכן ממלכות איים כמו ממלכת קלינגגה,
אימפריית סריביג'איה , ממלכת מדאנג ומג'אפהיט.נזירים בודהיסטים נסעו
לסין מממלכת פונן במאה ה-5 לספירה, והביאו טקסטים מהאיאנה, סימן לכך שהדת כבר התבססה באזור בשלב זה.בודהיזם מהאיאנה וההינדואיזם היו הדתות העיקריות של האימפריה החמרית (802–1431), מדינה ששלטה ברוב חצי האי דרום-מזרח אסיה בתקופתה.תחת החמר, נבנו בקמבודיה ובתאילנד השכנה מקדשים רבים, הינדיים ובודהיסטים כאחד.אחד ממלכי החמר הגדולים ביותר, ג'איווארמן השביעי (1181–1219), בנה מבנים בודהיסטיים מהאיאנה גדולים בביון ובאנגקור תום.באי
האינדונזי ג'אווה, ממלכות אינדיאניות כמו ממלכת קלינגגה (מאות 6-7) היו יעדים לנזירים סינים שחיפשו טקסטים בודהיסטים.הסריביג'איה המלאית (650–1377), אימפריה ימית שבמרכזה האי סומטרה, אימצה את הבודהיזם המהאיאנה והוג'רייאנה והפיצה את הבודהיזם לג'אווה,
מלאיה ואזורים נוספים שכבשו.