یونانیان دوره کلاسیک بر این باور بودند که در عصر تاریکی که پس از فروپاشی تمدن میسنی به وجود آمد، تعداد قابل توجهی از یونانیان گریختند و به آسیای صغیر مهاجرت کردند و در آنجا ساکن شدند.این مهاجران از سه گروه قبیله ای بودند: آئولی ها، دوریان ها و ایونی ها.یونی ها در سواحل لیدیا و کاریا ساکن شده بودند و دوازده شهر را که یونیا را تشکیل می دادند تأسیس کردند.شهرهای ایونیا تا زمانی که توسط لیدیایان غرب آسیای صغیر فتح شدند مستقل باقی ماندند.شاهزاده ایرانی کوروش در سال 553 قبل از میلاد شورش علیه آخرین پادشاه مادها آستیاگ را رهبری کرد.کوروش هنگام نبرد با لیدی ها، پیام هایی برای ایونی ها فرستاده بود و از آنها می خواست که علیه حکومت لیدیا قیام کنند، که یونی ها از انجام آن سرباز زده بودند.پس از اینکه کوروش تسخیر لیدیا را به پایان رساند، شهرهای ایونیایی اکنون پیشنهاد کردند که تحت همان شرایطی که تابع کرزوس بودند، تابع او باشند.کوروش امتناع کرد و دلیل آن عدم تمایل ایونی ها به کمک قبلی بود.به این ترتیب یونی ها برای دفاع از خود آماده شدند و کوروش سردار ماد هارپاگوس را برای تسخیر آنها فرستاد.در سال‌های پس از فتح، ایرانیان برای حکومت یونیایی‌ها مشکل یافتند.بنابراین ایرانیان به حمایت از یک ظالم در هر شهر ایونی رضایت دادند، حتی اگر این امر آنها را به درگیری های داخلی ایونیایی ها کشاند.در آستانه جنگ‌های یونان و ایران، احتمال می‌رود که مردم ایونی ناراضی شده و آماده شورش شده باشند.