Một thời kỳ cai trị dưới thời Nhà Vasa của Thụy Điển bắt đầu trong Khối thịnh vượng chung vào năm 1587. Hai vị vua đầu tiên của triều đại này, Sigismund III (r. 1587–1632) và Władysław IV (r. 1632–1648), đã nhiều lần cố gắng âm mưu giành lấy ngai vàng của Thụy Điển, vốn là nguyên nhân thường xuyên gây xao lãng cho các công việc của Khối thịnh vượng chung.Vào thời điểm đó, Giáo hội Công giáo đã bắt tay vào một cuộc phản công về mặt tư tưởng và cuộc Phản cải cách đã thu hút nhiều người cải đạo từ giới Tin lành Ba Lan và Litva.Năm 1596, Liên minh Brest chia rẽ các Kitô hữu Đông phương trong Khối thịnh vượng chung để thành lập Nhà thờ Thống nhất Nghi thức Đông phương, nhưng chịu sự điều hành của giáo hoàng.Cuộc nổi dậy của Zebrzydowski chống lại Sigismund III diễn ra vào năm 1606–1608.Tìm kiếm quyền lực tối cao ở Đông Âu, Khối thịnh vượng chung đã gây chiến với Nga từ năm 1605 đến năm 1618 sau Thời kỳ rắc rối của Nga;Chuỗi xung đột này được gọi là Chiến tranh Ba Lan-Muscovite hay Dymitriads.Những nỗ lực này đã dẫn đến việc mở rộng các vùng lãnh thổ phía đông của Khối thịnh vượng chung Ba Lan-Litva, nhưng mục tiêu chiếm lấy ngai vàng của Nga cho triều đại cầm quyền Ba Lan đã không đạt được.Thụy Điển tìm kiếm quyền lực tối cao ở vùng Baltic trong Chiến tranh Ba Lan-Thụy Điển năm 1617–1629, và Đế quốc Ottoman bị ép từ phía nam trong các trận chiến tại Cecora năm 1620 và Khotyn năm 1621. Các chính sách mở rộng nông nghiệp và chế độ nông nô ở Ukraina thuộc Ba Lan đã dẫn đến một loạt các chính sách của các cuộc nổi dậy của người Cossack .Liên minh với chế độ quân chủ Habsburg, Khối thịnh vượng chung không trực tiếp tham giaChiến tranh Ba mươi năm. Triều đại IV của Władysław hầu hết diễn ra trong hòa bình, với cuộc xâm lược của Nga dưới hình thức Chiến tranh Smolensk năm 1632–1634 đã bị đẩy lùi thành công.Hệ thống phân cấp của Giáo hội Chính thống, bị cấm ở Ba Lan sau Liên minh Brest, được tái lập vào năm 1635.