Vào năm 1241–1242, vương quốc hứng chịu một đòn nặng nề sau cuộc xâm lược của người Mông Cổ vào châu Âu.Sau khi Hungary bị quân Mông Cổ xâm chiếm vào năm 1241, quân đội Hungary đã bị đánh bại thảm hại trong trận Mohi.Vua Béla IV đã chạy trốn khỏi chiến trường và sau đó là đất nước sau khi quân Mông Cổ truy đuổi ông đến tận biên giới.Trước khi quân Mông Cổ rút lui, một bộ phận lớn dân số (20-50%) đã chết.^[22] Ở vùng đồng bằng, từ 50 đến 80% khu định cư bị phá hủy.^[23] Chỉ có các lâu đài, thành phố kiên cố và tu viện mới có thể chống chọi được với cuộc tấn công, vì quân Mông Cổ không có thời gian cho các cuộc vây hãm kéo dài—mục tiêu của họ là di chuyển về phía tây càng sớm càng tốt.Các động cơ công thành và các kỹ sưTrung Quốc và Ba Tư vận hành chúng cho người Mông Cổ đã bị bỏ lại trên vùng đất bị chinh phục là Kyivan Rus'.^[24] Sự tàn phá do cuộc xâm lược của người Mông Cổ gây ra sau đó đã dẫn đến lời mời của những người định cư từ các vùng khác của châu Âu, đặc biệt là từ Đức.Trong chiến dịch của người Mông Cổ chống lại Kievan Rus, khoảng 40.000 người Cuman , thành viên của một bộ tộc du mục Kipchaks ngoại đạo, đã bị đẩy về phía tây dãy núi Carpathian.^[25] Tại đây, người Cumans đã cầu xin Vua Béla IV bảo vệ.^[26] Người Jassic Iran đến Hungary cùng với người Cuman sau khi họ bị quân Mông Cổ đánh bại.Người Cumans có lẽ chiếm tới 7–8% dân số Hungary vào nửa sau thế kỷ 13.^[27] Qua nhiều thế kỷ, họ đã hoàn toàn hòa nhập vào người dân Hungary và ngôn ngữ của họ biến mất, nhưng họ vẫn giữ được bản sắc và quyền tự trị khu vực của mình cho đến năm 1876. ^[28]Do hậu quả của cuộc xâm lược của người Mông Cổ, Vua Béla đã ra lệnh xây dựng hàng trăm lâu đài và công sự bằng đá để giúp phòng thủ trước cuộc xâm lược lần thứ hai của người Mông Cổ.Người Mông Cổ thực sự đã quay trở lại Hungary vào năm 1286, nhưng hệ thống lâu đài bằng đá mới được xây dựng và các chiến thuật quân sự mới với tỷ lệ hiệp sĩ được trang bị vũ khí hạng nặng cao hơn đã ngăn cản họ.Lực lượng Mông Cổ xâm lược đã bị quân đội hoàng gia của vua Ladislaus IV đánh bại gần Pest.Các cuộc xâm lược sau đó cũng bị đẩy lùi một cách dễ dàng.Các lâu đài do Béla IV xây dựng sau này tỏ ra rất hữu ích trong cuộc đấu tranh lâu dài chống lại Đế chế Ottoman .Tuy nhiên, chi phí xây dựng chúng đã khiến nhà vua Hungary mắc nợ các địa chủ phong kiến ​​​​lớn, do đó quyền lực hoàng gia được Béla IV giành lại sau khi cha ông là Andrew II suy yếu đáng kể, nó một lần nữa bị phân tán trong giới quý tộc thấp hơn.