1947'de Pakistan, Liyakat Ali Han'ın ilk Başbakanı ve Muhammed Ali Cinnah'ın Genel Vali ve Parlamento Başkanı olduğu yeni bir ulus olarak ortaya çıktı.Lord Mountbatten'in hem Hindistan hem de Pakistan'ın Genel Valisi olma teklifini reddeden Cinnah, 1948'deki ölümüne kadar ülkeyi yönetti. Onun liderliğinde Pakistan, özellikle Başbakan'ın Hedefler Kararı'nı uygulamaya koymasıyla İslam devleti olma yolunda adımlar attı. Khan 1949'da Allah'ın egemenliğini vurguluyor.Hedefler Kararı, tüm evrenin egemenliğinin Yüce Allah'a ait olduğunu ilan ediyordu.^[5]Pakistan'ın ilk yıllarında Hindistan'dan, özellikle de ilk başkent Karaçi'ye ^[6] önemli bir göç yaşandı.Pakistan'ın mali altyapısını güçlendirmek için Maliye Bakanı Victor Turner ülkenin ilk para politikasını uyguladı.Bu, ülkenin finans, vergilendirme ve gelir toplama konusundaki yeteneklerini geliştirmeyi amaçlayan Devlet Bankası, Federal İstatistik Bürosu ve Federal Gelir Kurulu gibi kilit kurumların kurulmasını da içeriyordu.^[7] Ancak Pakistan, Hindistan'la önemli sorunlarla karşılaştı.Nisan 1948'de Hindistan, Pencap'taki iki kanal başlığından Pakistan'a giden su kaynağını keserek iki ülke arasındaki gerilimi artırdı.Ek olarak, Hindistan başlangıçta Pakistan'ın Birleşik Hindistan'daki varlık ve fon payını alıkoydu.Bu varlıklar sonunda Mahatma Gandhi'nin baskısı altında serbest bırakıldı.^[8] 1949'da Pakistan-Afganistan sınırında komşu Afganistan'la ve Keşmir'deki Kontrol Hattı konusunda Hindistan'la bölgesel sorunlar ortaya çıktı.^[9]Ülke ayrıca İran'ın onu ilk tanıyan ülke olmasıyla uluslararası tanınma arayışına girdi, ancak başlangıçta Sovyetler Birliği ve İsrail'in isteksizliğiyle karşılaştı.Pakistan, Müslüman ülkeleri birleştirmeyi hedefleyerek Müslüman dünyasında aktif olarak liderlik peşinde koştu.Ancak bu hırs uluslararası düzeyde ve bazı Arap ülkeleri arasında şüpheyle karşı karşıya kaldı.Pakistan ayrıca Müslüman dünyasındaki çeşitli bağımsızlık hareketlerini de destekledi.Cinnah'ın Urduca'yı devlet dili olarak ilan etmesiyle ülke içinde dil politikası tartışmalı bir konu haline geldi ve bu da Doğu Bengal'de gerilimlere yol açtı.Cinnah'ın 1948'deki ölümünün ardından Sir Khawaja Nazimuddin Genel Vali oldu ve Pakistan'ın oluşum yıllarında ulus inşa etme çabalarını sürdürdü.