10 Ocak 1979'da, Vietnam ordusu ve KUFNS'nin (Kampuchean Ulusal Kurtuluş Birleşik Cephesi) Kamboçya'yı işgal etmesi ve Kızıl Kızıllar'ı devirmesinin ardından, Heng Samrin'in devlet başkanı olduğu yeni Kampuchea Halk Cumhuriyeti (PRK) kuruldu.Pol Pot'un Kızıl Khmer güçleri hızla Tayland sınırı yakınındaki ormanlara çekildi.Kızıl Khmerler ve PRK, büyük güçlerÇin , ABD ve Sovyetler Birliği'nin ekmeğine yağ süren maliyetli bir mücadele başlattı.Khmer Halkın Devrimci Partisi'nin yönetimi üç büyük direniş grubunun gerilla hareketine yol açtı: FUNCINPEC (Front Uni National pour un Cambodge Indépendant, Neutre, Pacifique, et Coopératif), KPLNF (Khmer Halk Ulusal Kurtuluş Cephesi) ve PDK ( Demokratik Kampuchea Partisi, Khieu Samphan'ın nominal başkanlığı altındaki Kızıl Khmerler).^[98] "Hepsi Kamboçya'nın geleceğinin amaçları ve yöntemlerine ilişkin muhalif algılara sahipti".İç savaş, Tayland sınırındaki mülteci kamplarına kaçan 600.000 Kamboçyalıyı yerinden etti ve ülke genelinde on binlerce insan öldürüldü.Barış çabaları ^[1989] yılında Kamboçya Devleti yönetimi altında Paris'te başladı ve iki yıl sonra Ekim 1991'de kapsamlı bir barış anlaşmasıyla sonuçlandı.Birleşmiş Milletler'e, Kamboçya'daki Birleşmiş Milletler Geçici Otoritesi (UNTAC) olarak bilinen ateşkesi uygulama ve mültecilerle ve silahsızlanmayla ilgilenme yetkisi verildi.^[100]