หลังจากสงครามกับตองอูในปี พ.ศ. 2090–49 กษัตริย์กรุงศรีอยุธยามหาจักรพัฒน์ได้สร้างแนวป้องกันในเมืองหลวงเพื่อเตรียมพร้อมสำหรับการทำสงครามกับพม่าในภายหลังสงครามระหว่างปี พ.ศ. 2090–49 สิ้นสุดลงด้วยชัยชนะในการป้องกันของสยามและรักษาเอกราชของสยามไว้อย่างไรก็ตาม ความทะเยอทะยานในดินแดนของบุเรงนองทำให้จักรภัทรต้องเตรียมพร้อมสำหรับการรุกรานอีกครั้งการเตรียมการเหล่านี้รวมถึงการสำรวจสำมะโนประชากรที่เตรียมคนเก่งทุกคนให้พร้อมเข้าสู่สงครามรัฐบาลยึดอาวุธและปศุสัตว์เพื่อเตรียมการทำสงครามขนาดใหญ่ และจักรภัทรจับช้างเผือกเจ็ดเชือกเพื่อความโชคดีข่าวการเตรียมการของกษัตริย์กรุงศรีอยุธยาแพร่สะพัดอย่างรวดเร็วจนไปถึงชาวพม่าในที่สุดบุเรงนองประสบความสำเร็จในการยึดเมืองเชียงใหม่ในอาณาจักรล้านนาที่อยู่ใกล้เคียงในปี พ.ศ. 2099 ความพยายามในเวลาต่อมาทำให้พื้นที่ส่วนใหญ่ทางตอนเหนือของสยามอยู่ภายใต้การควบคุมของพม่าทำให้อาณาจักรจักรพัฒน์ตกอยู่ในภาวะล่อแหลม ต้องเผชิญกับดินแดนศัตรูทางทิศเหนือและทิศตะวันตกต่อมาบุเรงนองได้เรียกร้องให้ช้างเผือกสองตัวของสมเด็จพระจักรพรรดิจักรภัทร์เป็นเครื่องบรรณาการแก่ราชวงศ์ตองอูที่รุ่งเรืองขึ้นจักรภัทรปฏิเสธ นำไปสู่การรุกรานอาณาจักรกรุงศรีอยุธยาครั้งที่สอง ของพม่ากองทัพบุเรงนองยกทัพลงมายังกรุงศรีอยุธยาที่นั่น พวกเขาถูกป้อมสยามกักไว้เป็นเวลาหลายสัปดาห์ โดยได้รับความช่วยเหลือจากเรือรบโปรตุเกสสามลำและปืนใหญ่ที่ท่าเรือในที่สุดผู้บุกรุกก็ยึดเรือและแบตเตอรี่ของโปรตุเกสได้ในวันที่ 7 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2107 หลังจากนั้นป้อมก็พังทลายลงทันทีด้วยกำลังทหาร 60,000 นายที่รวมกับกองทัพพิษณุโลก บุเรงนองก็มาถึงกำแพงเมืองกรุงศรีอยุธยาและระดมยิงถล่มเมือง ^{[อย่าง]} หนักแม้ว่าจะมีกำลังเหนือกว่า แต่พม่าก็ไม่สามารถยึดกรุงศรีอยุธยาได้ แต่เรียกร้องให้กษัตริย์สยามออกจากเมืองภายใต้ธงพักรบเพื่อการเจรจาสันติภาพเมื่อเห็นว่าราษฎรไม่สามารถปิดล้อมได้อีกต่อไป จักรภัทรจึงเจรจาสงบศึกแต่ใช้ราคาสูงเพื่อแลกกับการล่าถอยของกองทัพพม่า บุเรงนองได้จับกรมพระราเมศวร (ราชโอรสจักรพรรดิ์) พระยาจักรี และพระยาสุนทรสงคราม กลับพม่าไปเป็นตัวประกัน และช้างเผือกสยามอีกสี่เชือกมหาธรรมราชาแม้จะเป็นผู้ทรยศแต่ก็ยังเหลือไว้เป็นเจ้าเมืองพิษณุโลกและอุปราชแห่งสยามอาณาจักรกรุงศรีอยุธยากลายเป็นข้าราชบริพารของราชวงศ์ตองอู โดยกำหนดให้ช้าง 30 เชือกและเงิน 300 เหรียญแก่ชาวพม่าทุกปี