รัฐบาลของสมัครพยายามอย่างแข็งขันที่จะแก้ไขรัฐธรรมนูญ พ.ศ. 2550 และผลที่ตามมาคือกลุ่มพันธมิตรฯ ได้รวมกลุ่มกันใหม่ในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2551 เพื่อจัดการเดินขบวนต่อต้านรัฐบาลเพิ่มเติมพันธมิตรฯ กล่าวหารัฐบาลว่าพยายามนิรโทษกรรมแก่ทักษิณซึ่งถูกตั้งข้อหาทุจริตนอกจากนี้ยังหยิบยกประเด็นปัญหาจากการสนับสนุนของรัฐบาลกัมพูชาในการเสนอปราสาทพระวิหารให้เป็นมรดกโลกอีกด้วยสิ่งนี้นำไปสู่ความขัดแย้งเรื่องชายแดนกับ กัมพูชา ซึ่งต่อมาส่งผลให้มีผู้เสียชีวิตจำนวนมากในเดือนสิงหาคม พันธมิตรฯ ได้เพิ่มความรุนแรงในการประท้วง บุกยึดทำเนียบรัฐบาล ทำให้เจ้าหน้าที่ของรัฐต้องย้ายไปที่ทำการชั่วคราว และทำให้ประเทศเข้าสู่ภาวะวิกฤตทางการเมืองขณะเดียวกัน ศาลรัฐธรรมนูญตัดสินว่าสมัครมีความผิดฐานขัดผลประโยชน์เนื่องจากทำงานรายการทีวีทำอาหาร และพ้นตำแหน่งนายกรัฐมนตรีในเดือนกันยายนรัฐสภาจึงเลือกสมชาย วงศ์สวัสดิ์ รองหัวหน้าพรรคพลังประชาชน เป็นนายกรัฐมนตรีคนใหม่สมชายเป็นพี่เขยของทักษิณ และพันธมิตรฯ ปฏิเสธการเลือกของเขาและประท้วงต่อไป^[81]ทักษิณต้องลี้ภัยตั้งแต่รัฐประหารกลับมายังประเทศไทยในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2551 หลังจากที่พรรคพลังประชาชนขึ้นสู่อำนาจเท่านั้นอย่างไรก็ตาม ในเดือนสิงหาคม ท่ามกลางการประท้วงของพันธมิตรฯ และการพิจารณาคดีในศาลของเขาและภรรยา ทักษิณและภริยา พจมาน ได้ประกันตัวและยื่นขอลี้ภัยในสหราชอาณาจักร ซึ่งถูกปฏิเสธต่อมาเขาถูกตัดสินว่ามีความผิดฐานใช้อำนาจโดยมิชอบในการช่วยพจมานซื้อที่ดินบนถนนรัชดาภิเษก และในเดือนตุลาคม ศาลฎีกาพิพากษาให้จำคุกสองปีโดยไม่อยู่เลย^[82]พันธมิตรฯ ยังได้เพิ่มการประท้วงในเดือนพฤศจิกายน ส่งผลให้ต้องปิดสนามบินนานาชาติทั้งสองแห่งในกรุงเทพฯหลังจากนั้นไม่นาน ในวันที่ 2 ธันวาคม ศาลรัฐธรรมนูญได้ยุบพรรคพลังประชาชนและพรรคร่วมอีกสองพรรค ฐานฉ้อโกงการเลือกตั้ง ส่งผลให้สมชายดำรงตำแหน่งนายกรัฐมนตรีสิ้นสุดลง^[83] จากนั้นพรรคประชาธิปัตย์ฝ่ายค้านได้จัดตั้งรัฐบาลผสมชุดใหม่ โดยมีอภิสิทธิ์ เวชชาชีวะ เป็นนายกรัฐมนตรี^[84]