ตั้งแต่ปี พ.ศ. 2520 ถึง พ.ศ. 2531 ปากีสถานเผชิญกับช่วงเวลาแห่งการปกครองโดยทหารภายใต้นายพลเซียอุลฮัก ซึ่งโดดเด่นด้วยการเติบโตของลัทธิอนุรักษ์นิยมทางศาสนาและการประหัตประหารที่รัฐสนับสนุนZia มุ่งมั่นที่จะสถาปนารัฐอิสลามและบังคับใช้กฎหมายชารีอะห์ การจัดตั้งศาลชารีอะห์แยกจากกัน และการแนะนำกฎหมายอาญาอิสลาม รวมถึงการลงโทษที่รุนแรงการทำให้อิสลามทางเศรษฐกิจรวมถึงการเปลี่ยนแปลงต่างๆ เช่น การแทนที่การจ่ายดอกเบี้ยด้วยส่วนแบ่งกำไรขาดทุน และการเก็บภาษีซะกาตการปกครองของเซียยังเห็นการปราบปรามอิทธิพลสังคมนิยมและการผงาดขึ้นของระบอบเทคโนโลยี โดยมีนายทหารที่เข้ามามีบทบาทพลเรือน และนโยบายทุนนิยมได้รับการนำกลับมาใช้ใหม่ขบวนการฝ่ายซ้ายที่นำโดยบุตโตต้องเผชิญกับการปราบปรามอย่างโหดร้าย ในขณะที่ขบวนการแบ่งแยกดินแดนในบาโลจิสถานถูกปราบปรามเซียจัดการลงประชามติในปี 1984 โดยได้รับการสนับสนุนจากนโยบายทางศาสนาของเขาความสัมพันธ์ระหว่างประเทศของปากีสถานเปลี่ยนไป โดยความสัมพันธ์ที่ถดถอยกับ สหภาพโซเวียต และความสัมพันธ์ที่แน่นแฟ้นยิ่งขึ้นกับ สหรัฐอเมริกา โดยเฉพาะอย่างยิ่งหลังจากการแทรกแซงของสหภาพโซเวียตใน อัฟกานิสถานปากีสถานกลายเป็นผู้เล่นหลักในการสนับสนุนกองกำลังต่อต้านโซเวียต ขณะเดียวกันก็จัดการกับผู้ลี้ภัยชาวอัฟกานิสถานที่หลั่งไหลเข้ามาจำนวนมาก และเผชิญกับความท้าทายด้านความปลอดภัยความตึงเครียดกับ อินเดีย เพิ่มสูงขึ้น รวมถึงความขัดแย้งเกี่ยวกับธารน้ำแข็ง Siachen และการวางท่าทางทหารZia ใช้การทูตคริกเก็ตเพื่อบรรเทาความตึงเครียดกับอินเดีย และออกแถลงการณ์ที่ยั่วยุเพื่อขัดขวางการดำเนินการทางทหารของอินเดียภายใต้แรงกดดันของสหรัฐฯ เซียยกเลิกกฎอัยการศึกในปี 1985 โดยแต่งตั้งมูฮัมหมัด ข่าน จูเนโจ เป็นนายกรัฐมนตรี แต่ต่อมาก็ไล่เขาออกท่ามกลางความตึงเครียดที่เพิ่มมากขึ้นZia เสียชีวิตในเหตุเครื่องบินตกอย่างลึกลับในปี 1988 โดยทิ้งมรดกที่มีอิทธิพลทางศาสนาที่เพิ่มขึ้นในปากีสถานและการเปลี่ยนแปลงทางวัฒนธรรมไว้เบื้องหลัง พร้อมกับการเพิ่มขึ้นของดนตรีร็อคอันเดอร์กราวด์ที่ท้าทายบรรทัดฐานอนุรักษ์นิยม