สงครามไคดู–กุบไลเป็นสงครามระหว่างไคดู ผู้นำราชวงศ์โอเกไดและข่านโดยพฤตินัยแห่งชากาไตคานาเตะในเอเชียกลาง กับกุบไล ข่าน ผู้ก่อตั้งราชวงศ์หยวนในจีน และผู้สืบทอดต่อจากเขา เทมูร์ ข่านที่กินเวลายาวนาน ไม่กี่ทศวรรษตั้งแต่ปี 1268 ถึง 1301 เกิดขึ้นภายหลังสงครามกลางเมืองโทลูอิด (1260–1264) และส่งผลให้เกิดการแบ่งแยกจักรวรรดิมองโกลอย่างถาวรเมื่อกุบไลสวรรคตในปี ค.ศ. 1294 จักรวรรดิมองโกลได้แตกแยกออกเป็นสี่อาณาจักรคานาเตะหรือจักรวรรดิ ได้แก่ คานาเตะกลุ่มทองคำทางตะวันตกเฉียงเหนือ ชะกาไตคานาเตะที่อยู่ตรงกลาง อิลคาเนท ทางตะวันตกเฉียงใต้ และราชวงศ์หยวนทางตะวันออก ในกรุงปักกิ่งยุคปัจจุบันแม้ว่า Temür Khan จะสร้างสันติภาพกับคานาเตะตะวันตกทั้งสามในเวลาต่อมาในปี 1304 หลังจาก Kaidu เสียชีวิต แต่คานาเตะทั้งสี่ก็ยังคงพัฒนาแยกจากกันและแตกสลายในเวลาที่ต่างกัน