La scurt timp după încoronare, Coloman a trebuit să se confrunte cu probleme pe care armatele primei cruciade le-au provocat în timpul trecerii prin Ungaria.Timp de decenii, Ungaria a fost capabilă să aprovizioneze un număr semnificativ de pelerini vest-europeni cu hrană în timpul călătoriei lor către Țara Sfântă, dar mișcarea a zeci de mii de cruciați în toată țara a pus în pericol subzistența băștinașilor.Primul grup de cruciați, condus de Walter Sans Avoir, a ajuns la graniță la începutul lui mai 1096. Coloman i-a primit într-un mod prietenos și le-a permis să intre în regat.De asemenea, i-a autorizat să cumpere alimente din piețe, deși recolta nu începuse încă.Au trecut prin Ungaria fără conflicte majore.Următorii sosiri, în frunte cu Petru Pustnicul, au sosit la sfârșitul lunii mai sau începutul lunii iunie.Coloman le-a permis să intre în Ungaria numai după ce Peter a promis că îi va împiedica să jefuiască zona rurală.Conform înregistrărilor lui Guibert din Nogent, Petru nu și-a putut ține promisiunea: cruciații „au ars grânarele publice..., au violat fecioare, au dezonorat multe paturi conjugale ducând multe femei”, deși „ungurii, ca creștini pentru creștini, au avut le-a oferit cu generozitate totul spre vânzare”.O a treia bandă de cruciați a ajuns la Nyitra (Nitra, Slovacia) și a început să jefuiască regiunea.Acestea au fost în scurt timp deplasate de localnici.O a patra armată a venit la Moson la mijlocul lunii iunie.Coloman nu le-a permis să părăsească regiunea, fie pentru că aflase de comportamentul lor supărător în timpul călătoriei lor, fie și-a dat seama că deplasarea lor prin Ungaria ar putea pune în pericol stabilitatea economiei locale.Pentru a pune mâna pe mâncare și vin, cruciații au făcut raiduri frecvente de jaf împotriva așezărilor din apropiere.Coloman a decis să-i atace, dar comandanții armatei l-au convins să-i convingă pe cruciați să-și predea armele și banii, promițându-le că vor fi aprovizionați cu hrană în timpul călătoriei.După ce cruciații au fost dezarmați, trupele lui Coloman i-au atacat și i-au masacrat lângă Pannonhalma la începutul lunii iulie.