Atenienii au căzut acum înapoi pe insula Prosopitis din delta Nilului, unde navele lor erau ancorate. Acolo, Megabyzus i-a asediat timp de 18 luni, până când în cele din urmă a reușit să dreneze râul din jurul insulei prin săparea canalelor, „unind astfel insula de continent”. În relatarea lui Tucidide, perșii au trecut apoi pe fosta insulă și au capturat-o. Doar câțiva dintre forțele ateniene, care mărșăluiau prin Libia până la Cirene, au supraviețuit pentru a se întoarce la Atena. În versiunea lui Diodor, însă, scurgerea râului i-a determinat pe egipteni (pe care Tucidide nu îi menționează) să dezerteze și să se predea perșilor. Perșii, nedorind să sufere pierderi grele în atacarea atenienilor, le-au permis în schimb să plece liber în Cirene, de unde s-au întors la Atena. Întrucât înfrângerea expediției egiptene a provocat o adevărată panică în Atena, inclusiv mutarea tezaurului delian în Atena, versiunea lui Tucidide este probabil mai corectă.