De Franse expeditie naar Egypte , ogenschijnlijk om de Ottomaanse Porte te steunen en deMamelukken te onderdrukken, werd geleid door Napoleon Bonaparte.Bonaparte's proclamatie in Alexandrië legde de nadruk op gelijkheid, verdienste en respect voor de islam, in contrast met het veronderstelde gebrek aan deze kwaliteiten bij de Mamelukken.Hij beloofde open toegang voor alle Egyptenaren voor administratieve posten en stelde de omverwerping van het pauselijke gezag voor om aan te tonen dat de Fransen zich aan de islam houden.^[102]De Egyptenaren stonden echter sceptisch tegenover de Franse bedoelingen.Na de Franse overwinning in de Slag om Embabeh (Slag om de Piramides), waar de strijdkrachten van Murad Bey en Ibrahim Bey werden verslagen, werd in Caïro een gemeenteraad gevormd met sjeiks, Mamelukken en Franse leden, die voornamelijk diende om Franse decreten af ​​te dwingen.^[102]De Franse onoverwinnelijkheid werd in twijfel getrokken na de nederlaag van hun vloot in de Slag om de Nijl en de mislukking in Opper-Egypte.De spanningen escaleerden met de introductie van een huizenbelasting, wat leidde tot een opstand in Caïro in oktober 1798. De Franse generaal Dupuy werd vermoord, maar Bonaparte en generaal Kléber onderdrukten de opstand snel.Het Franse gebruik van de Al-Azhar-moskee als stal veroorzaakte een diepe belediging.^[102]Bonaparte's Syrische expeditie in 1799 verzwakte tijdelijk de Franse controle in Egypte.Bij zijn terugkeer versloeg hij een gezamenlijke aanval van Murad Bey en Ibrahim Bey, en verpletterde later een Turks leger bij Aboukir.Bonaparte verliet vervolgens Egypte en benoemde Kléber tot zijn opvolger.^[102] Kléber werd geconfronteerd met een precaire situatie.Nadat de aanvankelijke overeenkomsten voor de Franse evacuatie door de Britten waren geblokkeerd, kreeg Caïro te maken met rellen, die Kléber onderdrukte.Hij onderhandelde met Murad Bey en verleende hem de controle over Opper-Egypte, maar Kléber werd in juni 1800 vermoord ^[.]Generaal Jacques-Francois Menou volgde Kléber op, in een poging de gunst van de moslims te winnen, maar de Egyptenaren van zich te vervreemden door een Frans protectoraat uit te roepen.In 1801 landden Engelse en Turkse troepen in Abu Qir, wat leidde tot Franse nederlagen.Generaal Belliard gaf Caïro in mei over, en Menou capituleerde in augustus in Alexandrië, waarmee een einde kwam aan de Franse bezetting.^[102] De blijvende erfenis van de Franse bezetting was de 'Description de l'Egypte', een gedetailleerde studie van Egypte door Franse geleerden, die aanzienlijk heeft bijgedragen aan het vakgebied van de egyptologie.^[102]