1947 онд Пакистан шинэ улс болон гарч ирж, анхны Ерөнхий сайдаар Лиакват Али Хан, Ерөнхий захирагч, парламентын даргаар Мухаммед Али Жинна нар ажиллажээ.Жинна Лорд Маунтбаттены Энэтхэг , Пакистаны ерөнхий захирагчаар томилох саналыг няцааж, 1948 онд нас барах хүртлээ тус улсыг удирдсан. Түүний удирдлаган дор Пакистан Исламын улс болох алхмуудыг хийж, ялангуяа Ерөнхий сайдын зорилтын тогтоолыг танилцуулснаар Пакистан улс Исламын улс болох алхам хийсэн. Хан 1949 онд Аллахын бүрэн эрхт байдлыг онцлон тэмдэглэв.Зорилтуудын тогтоолд бүх орчлон ертөнцийн бүрэн эрх нь Төгс Хүчит Аллахын мэдэлд байна гэж тунхагласан.^[5]Пакистаны эхний жилүүдэд Энэтхэгээс, ялангуяа Карачи руу ^[6] анхны нийслэл рүү ихээхэн шилжин суурьшсан.Пакистаны санхүүгийн дэд бүтцийг бэхжүүлэхийн тулд түүний Сангийн нарийн бичгийн дарга Виктор Тернер тус улсын анхны мөнгөний бодлогыг хэрэгжүүлсэн.Үүнд Улсын банк, Холбооны Статистикийн Товчоо, Холбооны Орлогын Зөвлөл зэрэг улс орны санхүү, татвар, орлого бүрдүүлэлтийн чадавхийг нэмэгдүүлэх зорилготой гол байгууллагуудыг байгуулсан.^[7] Гэсэн хэдий ч Пакистан Энэтхэгтэй томоохон асуудалтай тулгарсан.1948 оны 4-р сард Энэтхэг Пунжаб дахь хоёр сувгийн эх үүсвэрээс Пакистан руу нийлүүлэх усыг тасалснаар хоёр улсын хоорондын хурцадмал байдлыг улам хурцатгав.Нэмж дурдахад Энэтхэг улс эхэндээ Нэгдсэн Энэтхэгээс Пакистаны эзэмшиж байсан хөрөнгө, хөрөнгийг хурааж авсан.Эдгээр хөрөнгийг эцэст нь Махатма Гандигийн шахалтаар чөлөөлөв.^[8] 1949 онд хөрш Афганистантай Пакистан-Афганистаны хил, Энэтхэгтэй Кашмир дахь хяналтын шугамын асуудлаар газар нутгийн асуудал үүссэн.^[9]Тус улс мөн олон улсад хүлээн зөвшөөрөгдөхийг эрэлхийлж байсан бөгөөд үүнийг Иран хамгийн түрүүнд хүлээн зөвшөөрсөн боловч ЗХУ , Израилийн анхны дургүйцэлтэй тулгарсан.Пакистан нь мусульман шашинтай орнуудыг нэгтгэх зорилготойгоор лалын ертөнцийн манлайлалыг идэвхтэй баримталж байв.Гэсэн хэдий ч энэ хүсэл эрмэлзэл олон улсын хэмжээнд болон Арабын зарим үндэстний дунд эргэлзээтэй тулгарсан.Пакистан мөн лалын ертөнц дэх янз бүрийн тусгаар тогтнолын хөдөлгөөнийг дэмжиж байв.Дотоодод хэлний бодлого маргаантай асуудал болж, Жинна урду хэлийг төрийн хэл болгон зарласнаар Зүүн Бенгалд хурцадмал байдал үүссэн.1948 онд Жиннаг нас барсны дараа сэр Хаважа Назимуддин Ерөнхий захирагч болж, Пакистан улс бүрэлдэн тогтох жилүүдэд үндэстнийг байгуулах хүчин чармайлтаа үргэлжлүүлэв.