នៅឆ្នាំ 1958 ប្រព័ន្ធសភារបស់ប្រទេសប៉ាគីស្ថានបានបញ្ចប់ដោយការដាក់ច្បាប់អាជ្ញាសឹក។ការមិនពេញចិត្តជាសាធារណៈជាមួយនឹងអំពើពុករលួយនៅក្នុងការិយាធិបតេយ្យ និងរដ្ឋបាលស៊ីវិលបាននាំឱ្យមានការគាំទ្រដល់សកម្មភាពរបស់ឧត្តមសេនីយ៍ Ayub Khan ។^[16] រដ្ឋាភិបាលយោធាបានធ្វើកំណែទម្រង់ដីធ្លីដ៏សំខាន់ និងបានអនុវត្តដីកាដកសិទ្ធិជ្រើសរើសស្ថាប័ន ដោយរារាំង HS Suhrawardy ពីការិយាល័យសាធារណៈ។Khan បានណែនាំ "Basic Democracy" ដែលជាប្រព័ន្ធប្រធានាធិបតីថ្មី ដែលមហាវិទ្យាល័យបោះឆ្នោតចំនួន 80,000 នាក់បានជ្រើសរើសប្រធានាធិបតី ហើយបានប្រកាសឱ្យប្រើរដ្ឋធម្មនុញ្ញឆ្នាំ 1962 ។^[17] នៅឆ្នាំ 1960 Ayub Khan បានទទួលការគាំទ្រដ៏ពេញនិយមនៅក្នុងប្រជាមតិជាតិ ដោយផ្លាស់ប្តូរពីយោធាទៅជារដ្ឋាភិបាលស៊ីវិលតាមរដ្ឋធម្មនុញ្ញ។^[16]ការវិវឌ្ឍន៍សំខាន់ៗក្នុងអំឡុងពេលកាន់តំណែងជាប្រធានាធិបតីរបស់ Ayub Khan រួមមានការផ្លាស់ប្តូរទីតាំងហេដ្ឋារចនាសម្ព័ន្ធរបស់រដ្ឋធានីពី Karachi ទៅកាន់ទីក្រុង Islamabad ។យុគសម័យនេះ ត្រូវបានគេស្គាល់ថាជា "ទសវត្សរ៍ដ៏អស្ចារ្យ" ត្រូវបានប្រារព្ធសម្រាប់ការអភិវឌ្ឍន៍សេដ្ឋកិច្ច និងការផ្លាស់ប្តូរវប្បធម៌ ^[18] រួមទាំងការកើនឡើងនៃតន្ត្រីប៉ុប ភាពយន្ត និងឧស្សាហកម្មរឿងល្ខោន។Ayub Khan បានតម្រឹមប៉ាគីស្ថានជាមួយ សហរដ្ឋអាមេរិក និងលោកខាងលិច ដោយចូលរួមជាមួយអង្គការសន្ធិសញ្ញាកណ្តាល (CENTO) និងអង្គការសន្ធិសញ្ញាអាស៊ីអាគ្នេយ៍ (SEATO) ។វិស័យឯកជនបានរីកចម្រើន ហើយប្រទេសនេះបានបោះជំហានទៅមុខក្នុងវិស័យអប់រំ ការអភិវឌ្ឍន៍មនុស្ស និងវិទ្យាសាស្ត្រ រួមទាំងការបើកដំណើរការកម្មវិធីអវកាស និងបន្តកម្មវិធីថាមពលនុយក្លេអ៊ែរ។^[18]ទោះជាយ៉ាងណាក៏ដោយ ឧប្បត្តិហេតុយន្តហោះស៊ើបការណ៍ U2 ក្នុងឆ្នាំ 1960 បានលាតត្រដាងប្រតិបត្តិការសម្ងាត់របស់អាមេរិកពីប៉ាគីស្ថាន ដោយធ្វើឱ្យប៉ះពាល់ដល់សន្តិសុខជាតិ។នៅឆ្នាំដដែលនោះ ប៉ាគីស្ថានបានចុះហត្ថលេខាលើសន្ធិសញ្ញាដែនទឹក Indus ជាមួយ ឥណ្ឌា ដើម្បីធ្វើឱ្យទំនាក់ទំនងមានលក្ខណៈធម្មតា។^[19] ទំនាក់ទំនងជាមួយ ប្រទេសចិន បានពង្រឹង ជាពិសេសបន្ទាប់ពីសង្គ្រាមចិន-ឥណ្ឌា ដែលនាំឱ្យមានកិច្ចព្រមព្រៀងព្រំដែននៅឆ្នាំ 1963 ដែលបានផ្លាស់ប្តូរសក្ដានុពល នៃសង្គ្រាមត្រជាក់ ។នៅឆ្នាំ 1964 កងកម្លាំងប្រដាប់អាវុធប៉ាគីស្ថានបានបង្ក្រាបការបះបោរដែលសង្ស័យថាគាំទ្រកុម្មុយនិស្តនៅប៉ាគីស្ថានខាងលិច ហើយនៅឆ្នាំ 1965 Ayub Khan បានឈ្នះការបោះឆ្នោតប្រធានាធិបតីដ៏ចម្រូងចម្រាសប្រឆាំងនឹង Fatima Jinnah ។