ირანში დაარსებული ხვარაზმელთა დინასტია მხოლოდ ჩინგიზ ხანის ქვეშ მყოფი მონღოლების შემოსევამდე გაგრძელდა.1218 წლისთვის სწრაფად გაფართოებული მონღოლთა იმპერია ესაზღვრებოდა ხვარაზმის ტერიტორიას.ალა ად-დინ მუჰამედმა, ხვარაზმის მმართველმა, გააფართოვა თავისი სამეფო ირანის უმეტეს ნაწილზე და თავი შაჰად გამოაცხადა, აბასიან ხალიფას ალ-ნასირის აღიარებას ცდილობდა, რაც უარყო.მონღოლთა შეჭრა ირანში 1219 წელს დაიწყო მას შემდეგ, რაც მისი დიპლომატიური მისიები ხორეზმში გაანადგურეს.შეჭრა იყო სასტიკი და ყოვლისმომცველი;დიდი ქალაქები, როგორიცაა ბუხარა, სამარკანდი, ჰერატი, ტუსი და ნიშაპური, განადგურდა და მათი მოსახლეობა დახოცეს.ალა ად-დინ მუჰამედი გაიქცა და საბოლოოდ გარდაიცვალა კასპიის ზღვის კუნძულზე.ამ შემოსევის დროს მონღოლებმა გამოიყენეს მოწინავე სამხედრო ტექნიკა, მათ შორის ჩინური კატაპულტის ნაწილები და შესაძლოა დენთის ბომბები.ჩინელი ჯარისკაცები, რომლებიც დახელოვნებულნი იყვნენ დენთის ტექნოლოგიაში, იყვნენ მონღოლთა არმიის ნაწილი.ითვლება, რომ მონღოლთა დაპყრობამ ცენტრალურ აზიაში ჩინეთის დენთის იარაღი, მათ შორის ჰუოჩონგი (ნაღმტყორცნები) შემოიტანა.შემდგომი ადგილობრივი ლიტერატურა ასახავდა დენთის იარაღს, რომელიც გამოიყენებოდაჩინეთში .მონღოლთა შემოსევა, რომელიც დასრულდა ჩინგიზ ხანის სიკვდილით 1227 წელს, დამანგრეველი იყო ირანისთვის.ამან გამოიწვია მნიშვნელოვანი განადგურება, მათ შორის დასავლეთ აზერბაიჯანის ქალაქების ძარცვა.მონღოლებმა, მიუხედავად იმისა, რომ მოგვიანებით ისლამი მიიღეს და ირანულ კულტურაში ასიმილირდნენ, გამოუსწორებელი ზიანი მიაყენეს.მათ გაანადგურეს მრავალსაუკუნოვანი ისლამური სწავლება, კულტურა და ინფრასტრუქტურა, გაანადგურეს ქალაქები, დაწვეს ბიბლიოთეკები და შეცვალეს მეჩეთები ბუდისტური ტაძრებით ზოგიერთ რაიონში.^[38]შეჭრამ ასევე კატასტროფული გავლენა იქონია ირანის სამოქალაქო ცხოვრებაზე და ქვეყნის ინფრასტრუქტურაზე.ყანატის სარწყავი სისტემების განადგურებამ, განსაკუთრებით ირანის ჩრდილო-აღმოსავლეთში, დაარღვია დასახლებების სქემა, რამაც გამოიწვია მრავალი ოდესღაც აყვავებული სასოფლო-სამეურნეო ქალაქის მიტოვება.^[39]ჩინგიზ ხანის გარდაცვალების შემდეგ ირანს მართავდნენ სხვადასხვა მონღოლი სარდლები.ჰულაგუ ხანი, ჯენგისის შვილიშვილი, პასუხისმგებელი იყო მონღოლთა ძალაუფლების შემდგომი დასავლეთის გაფართოებაზე.თუმცა, მის დროისთვის მონღოლთა იმპერია დაყოფილი იყო სხვადასხვა ფრაქციად.ჰულაგუმ დააარსა ილხანატი ირანში, მონღოლთა იმპერიის სეპარატისტულ სახელმწიფოში, რომელიც მართავდა ოთხმოცი წლის განმავლობაში და სულ უფრო სპარსიზდებოდა.1258 წელს ჰულაგუმ აიღო ბაღდადი და სიკვდილით დასაჯა ბოლო აბასიდი ხალიფა.მისი ექსპანსია შეჩერდა აინ ჯალუტის ბრძოლაში პალესტინაში 1260 წელს მამელუკების მიერ.გარდა ამისა, ჰულაგუს კამპანიებმა მუსლიმების წინააღმდეგ გამოიწვია კონფლიქტი ბერკესთან, ოქროს ურდოს მუსლიმ ხანთან, რაც ხაზს უსვამს მონღოლთა ერთიანობის დაშლას.ჰულაგუს შვილიშვილის ღაზანის (რ. 1295–1304) დროს ილხანთა სახელმწიფო რელიგიად ისლამი დამკვიდრდა.ღაზანმა თავის ირანელ ვეზირთან რაშიდ ალ-დინთან ერთად წამოიწყო ეკონომიკური აღორძინება ირანში.მათ შეამცირეს გადასახადები ხელოსნებისთვის, ხელი შეუწყეს სოფლის მეურნეობას, აღადგინეს სარწყავი სამუშაოები და გააძლიერეს სავაჭრო გზების უსაფრთხოება, რამაც გამოიწვია ვაჭრობის ზრდა.ამ მოვლენებმა ხელი შეუწყო კულტურულ გაცვლას მთელს აზიაში, გაამდიდრა ირანული კულტურა.შესამჩნევი შედეგი იყო ირანული მხატვრობის ახალი სტილის გაჩენა, მესოპოტამიური და ჩინური მხატვრული ელემენტების შერწყმა.თუმცა, ღაზანის ძმისშვილის, აბუ საიდის გარდაცვალების შემდეგ 1335 წელს, ილხანატი გადაიზარდა სამოქალაქო ომში და დაიშალა რამდენიმე მცირე დინასტიად, მათ შორის ჯალაირიდები, მუზაფარიდები, სარბადარები და კარტიდები.მე-14 საუკუნეში ასევე მოხდა შავი ჭირის დამანგრეველი გავლენა, რომელმაც ირანის მოსახლეობის დაახლოებით 30% იმსხვერპლა.^[40]