Nel 1988, la democrazia è stata ristabilita in Pakistan con le elezioni generali dopo la morte del presidente Zia-ul-Haq.Queste elezioni hanno portato al ritorno al potere del Partito popolare pakistano (PPP), con Benazir Bhutto che è diventata la prima donna Primo Ministro del Pakistan e la prima donna capo di governo in un paese a maggioranza musulmana.Questo periodo, durato fino al 1999, è stato caratterizzato da un sistema bipartitico competitivo, con i conservatori di centrodestra guidati da Nawaz Sharif e i socialisti di centrosinistra guidati da Benazir Bhutto.Durante il suo mandato, la Bhutto guidò il Pakistan attraverso le fasi finali della Guerra Fredda , mantenendo politiche filo-occidentali a causa di una sfiducia condivisa nei confronti del comunismo.Il suo governo ha assistito al ritiro delle truppe sovietiche dall'Afghanistan .Tuttavia, la scoperta del progetto della bomba atomica del Pakistan ha portato a rapporti tesi con gli Stati Uniti e all'imposizione di sanzioni economiche.Anche il governo di Bhutto ha dovuto affrontare sfide in Afghanistan, con un fallito intervento militare che ha portato al licenziamento dei direttori dei servizi di intelligence.Nonostante gli sforzi per rivitalizzare l'economia, compreso il settimo piano quinquennale, il Pakistan ha sperimentato la stagflazione e il governo di Bhutto è stato infine destituito dal presidente conservatore Ghulam Ishaq Khan.