Nel 1958 il sistema parlamentare pakistano terminò con l’imposizione della legge marziale.La disillusione pubblica nei confronti della corruzione nella burocrazia civile e nell'amministrazione ha portato a sostenere le azioni del generale Ayub Khan.^[16] Il governo militare ha intrapreso significative riforme agrarie e ha applicato l'ordine di squalifica degli organi elettivi, escludendo HS Suhrawardy dalle cariche pubbliche.Khan introdusse la "democrazia di base", un nuovo sistema presidenziale in cui un collegio elettorale di 80.000 persone selezionava il presidente e promulgò la costituzione del 1962.^[17] Nel 1960, Ayub Khan ottenne il sostegno popolare in un referendum nazionale, passando da un governo militare a un governo civile costituzionale.^[16]Sviluppi significativi durante la presidenza di Ayub Khan includevano il trasferimento delle infrastrutture della capitale da Karachi a Islamabad.Questa era, conosciuta come il "Grande Decennio", è celebrata per il suo sviluppo economico e i cambiamenti culturali, ^[18] inclusa l'ascesa delle industrie della musica pop, del cinema e del teatro.Ayub Khan ha allineato il Pakistan con gli Stati Uniti e il mondo occidentale, unendosi all’Organizzazione del Trattato Centrale (CENTO) e all’Organizzazione del Trattato del Sud-Est asiatico (SEATO).Il settore privato è cresciuto e il paese ha fatto passi da gigante nel campo dell’istruzione, dello sviluppo umano e della scienza, compreso il lancio di un programma spaziale e il proseguimento del programma sull’energia nucleare.^[18]Tuttavia, l’incidente dell’aereo spia U2 nel 1960 rivelò operazioni segrete degli Stati Uniti dal Pakistan, compromettendo la sicurezza nazionale.Lo stesso anno, il Pakistan firmò il Trattato sulle acque dell'Indo con l'India per normalizzare le relazioni.^[19] Le relazioni con la Cina si rafforzarono, in particolare dopo la guerra sino-indiana, portando a un accordo sui confini nel 1963 che cambiò le dinamiche della Guerra Fredda .Nel 1964, le forze armate pakistane repressero una sospetta rivolta filo-comunista nel Pakistan occidentale e nel 1965 Ayub Khan vinse per un soffio le controverse elezioni presidenziali contro Fatima Jinnah.