Ֆաթիմյան խալիֆայությունը ՝ Իսմայիլի շիա դինաստիան, գոյություն է ունեցել մ.թ. 10-12-րդ դարերում։Այն անվանվել է իսլամ մարգարեՄուհամմեդի դստեր՝ Ֆաթիմայի և նրա ամուսնու՝ Ալի իբն Աբի Թալիբի անունով:Ֆաթիմիները ճանաչվել են տարբեր իսմայիլի համայնքների և մահմեդական այլ դավանանքների կողմից:^[87] Նրանց իշխանությունը տարածվում էր Արևմտյան Միջերկրականից մինչև Կարմիր ծով, ներառյալ Հյուսիսային Աֆրիկան, Մաղրեբի, Սիցիլիան, Լևանտի և Հեջազի մի մասը։Ֆաթիմյան պետությունը ստեղծվել է մ.թ. 902-909 թվականներին Աբու Աբդալլայի ղեկավարությամբ։Նա նվաճեց Աղլաբիդ Իֆրիքիան՝ ճանապարհ հարթելով խալիֆայության համար։^[88] Աբդալլահ ալ-Մահդի Բիլլան, ով ճանաչվել է իմամ, դարձավ առաջին խալիֆը 909 թ.^[89] Սկզբում ալ-Մահդիյան ծառայում էր որպես մայրաքաղաք, որը հիմնադրվել էր մ.թ. 921 թվականին, այնուհետև 948 թվականին տեղափոխվեց ալ-Մանսուրիյա։Ալ-Մուիզսի օրոք Եգիպտոսը գրավվեց մ.թ. 969 թվականին, իսկ Կահիրեն որպես նոր մայրաքաղաք հաստատվեց մ.թ. 973 թվականին։Եգիպտոսը դարձավ կայսրության մշակութային և կրոնական սիրտը, որը խթանեց յուրահատուկ արաբական մշակույթը:^[90]Ֆաթիմյան խալիֆայությունը հայտնի էր իր կրոնական հանդուրժողականությամբ ոչ շիա մահմեդականների, հրեաների և քրիստոնյաների նկատմամբ ^[91] , չնայած այն պայքարում էր Եգիպտոսի բնակչությանը դարձի բերել իր համոզմունքներին։^[92] Ալ-Ազիզի և ալ-Հակիմի օրոք և հատկապես ալ-Մուսթանսիրի օրոք խալիֆայությունը տեսավ, որ խալիֆաները ավելի քիչ էին ներգրավվում պետական ​​գործերի մեջ, իսկ վեզիրները ավելի մեծ իշխանություն էին ստանում:^[93] 1060-ականները բերեցին քաղաքացիական պատերազմ, որը բորբոքվեց բանակի ներսում քաղաքական և էթնիկական տարաձայնությունների պատճառով, որը սպառնում էր կայսրությանը:^[94]Չնայած վեզիր Բադր ալ-Ջամալիի օրոք կարճատև վերածննդին, Ֆաթիմյան խալիֆայությունը անկում ապրեց 11-րդ և 12-րդ դարերի վերջին ^[95] , որը հետագայում թուլացավ Սիրիայում սելջուկ թուրքերի և Լևանտի խաչակիրների կողմից։^[94] Մ.թ. 1171 թվականին Սալադինը վերացրեց Ֆաթիմյանների իշխանությունը՝ հիմնելով Այյուբիների դինաստիան և Եգիպտոսը վերաինտեգրելով Աբբասյան խալիֆայության իշխանությանը։^[96]