Míg a Pogány Birodalom bukását követő interregnum több mint 250 évig tartott (1287–1555), addig az Első Taungoo bukását követő időszak viszonylag rövid életű volt.Bayinnaung egyik fia, Nyaungyan Min azonnal megkezdte az újraegyesítési erőfeszítéseket, sikeresen visszaállítva a központi hatalmat Felső-Burma és a közelebbi Shan államok felett 1606-ra. Utódja, Anaukpetlun legyőzte a portugálokat Thanlyinnál 1613-ban. Visszaszerezte a felső Tanintharyi partvidéket Dawei-nek és Lan Na-nak. a sziámiaktól 1614-re. 1622–26-ban elfoglalta a transz-Salween Shan államokat (Kengtung és Sipsongpanna).Testvére, Thalun újjáépítette a háború sújtotta országot.1635-ben elrendelte a burmai történelem első népszámlálását, amely kimutatta, hogy a királyságnak körülbelül kétmillió lakosa van.1650-re a három tehetséges király – Nyaungjan, Anaukpetlun és Thalun – sikeresen újjáépített egy kisebb, de sokkal jobban kezelhető királyságot.Ennél is fontosabb, hogy az új dinasztia olyan jogi és politikai rendszert hozott létre, amelynek alapvető jellemzői a Konbaung-dinasztia alatt is fennmaradtak a 19. századig.A korona teljesen felváltotta az örökös főnökségeket kinevezett kormányzóságokkal az egész Irrawaddy-völgyben, és nagymértékben csökkentette a Shan főnökök örökös jogait.Megfékezte a szerzetesi vagyon és autonómia folyamatos növekedését is, nagyobb adóalapot biztosítva.Kereskedelmi és világi közigazgatási reformjai virágzó gazdaságot építettek fel több mint 80 éven át.^[55] Néhány alkalmi lázadástól és egy külső háborútól eltekintve – Burma 1662–64-ben legyőzte Sziám Lan Na és Mottama elfoglalására irányuló kísérletét – a királyság nagyrészt béke volt a 17. század hátralévő részében.A királyság fokozatos hanyatlásba lépett, és a "palotakirályok" tekintélye gyorsan romlott az 1720-as években.1724-től a Meitei nép portyázni kezdett a Chindwin folyó felső részén.1727-ben a déli Lan Na (Chiang Mai) sikeresen fellázadt, így éppen az északi Lan Na (Chiang Saen) egyre inkább névleges burmai uralom alá került.A meitei razziák az 1730-as években felerősödtek, és Burma középső részének egyre mélyebb részeit értek el.1740-ben a Mon Alsó-Burmában lázadásba kezdett, és megalapította a helyreállított Hanthawaddy Királyságot, és 1745-re Alsó-Burma nagy részét ellenőrzése alatt tartotta.1752-re a sziámiak is áthelyezték tekintélyüket a Tanintharyi partvidékre. Hanthawaddy 1751 novemberében megszállta Felső-Burmát, és 1752. március 23-án elfoglalta Ava-t, véget vetve a 266 éves Taungoo-dinasztiának.