Nyilvánvaló, hogy a demoralizált és fáradt görögök nem voltak párja a perzsáknak , és teljesen szétverték őket az efezusi csatában.Sokan meghaltak, köztük az eretriai tábornok, Eualcides.A csatából megmenekült iónok saját városaikért igyekeztek, míg a megmaradt athénieknek és eretriaknak sikerült visszatérniük hajóikra, és visszahajóztak Görögországba.Az athéniak most véget vetettek a jónokkal kötött szövetségüknek, mivel a perzsák mindennek bizonyultak, csak nem az Arisztagorasz által leírt könnyű prédák.A jónok azonban továbbra is elkötelezettek maradtak lázadásuk mellett, és úgy tűnt, hogy a perzsák nem követték efezusi győzelmüket.Feltehetően ezek az ad hoc erők nem voltak felszerelve arra, hogy egyik várost sem ostromolják.Az efezusi vereség ellenére a lázadás valójában tovább terjedt.Az iónok embereket küldtek a Hellespontba és Propontisba, és elfoglalták Bizáncot és a többi közeli várost.Meggyőzték a káriusokat is, hogy csatlakozzanak a lázadáshoz.Továbbá, látva a lázadás terjedését, a ciprusi királyságok is minden külső rábeszélés nélkül fellázadtak a perzsa uralom ellen.Így az efezusi csata nem gyakorolt ​​jelentős hatást a lázadásra.