עם סיום הניצחון האיברי על המורים,ספרד ופורטוגל האריכו את הסכסוך נגד האיסלאם מעבר לים.הספרדים תחת השושלת ההבסבורגית הפכו עד מהרה לאלופי הקתוליות הרומית באירופה ובים התיכון נגד האיום הפולש של האימפריה העות'מאנית .ברוח דומה, כיבוש סאוטה סימן את תחילת ההתפשטות הפורטוגלית לאפריקה המוסלמית.עד מהרה נלחמו הפורטוגזים גם עם הח'ליפות העות'מאנית בים התיכון, באוקיינוס ​​ההודי ובדרום מזרח אסיה כאשר הפורטוגלים כבשו את בעלות בריתם של העות'מאנים: סולטנות עדאל במזרח אפריקה, סולטנות דלהי בדרום אסיה וסולטנות מלאקה בדרום מזרח. אַסְיָה.בינתיים, הספרדים יצאו למלחמה גם נגד סולטנות ברוניי בדרום מזרח אסיה.הספרדים שלחו משלחות מספרד החדשה ( מקסיקו ) כדי לכבוש ולהנצר את הפיליפינים , אז שטח של סולטנות ברוניי.ברוניי עצמה הותקפה במהלך מלחמת קסטיליה.ספרד גם יצאה למלחמה נגד הסולטנות של סולו, מגווינדנאו ולנאו בסכסוך הספרדי-מורו.מעטים המוסלמים התנצרו בשטחים שנכבשו מחדש של איבריה, ורובם הורשו להישאר ולקיים את דתם כמיעוט מוגן, למעשה, מה שהפך את מעמדם של המוסלמים והנוצרים במאות השנים האחרונות.נוצרים עודדו להגר דרומה, שמות מקומות ערביים הוחלפו ומסגדים רבים הוסבו, מטבע הדברים, לכנסיות, אך חלקם נשארו וקריאות מוסלמיות לתפילה יכלו להישמע בערים ספרדיות רבות לאחר מכן.המדינות הנוצריות בספרד הפכו לחשודות הדדיות בכוונותיה של זו, כשכולם חששו שהממלכה השלטת של קסטיליה מתכוונת להשתלט על יריביה.זה גם התברר רחוק מלהיות קל עבור המדינות החדשות לשלוט על התחומים החדשים שלהן, ובמיוחד במעמד החדש של אילנים ששגשגו שם.זה עשוי להסביר מדוע מסדרים צבאיים מקומיים רבים הולאמו על ידי הכתר הקסטיליאני במחצית השנייה של המאה ה-15 לספירה.השפעות ארוכות טווח של מסעי הצלב בספרד כללו טיפוח דימוי של נוצרים כמועדפים במיוחד לשלטון, והרעיון יימשך מאות רבות לאחר מכן במוסדות הממשל הספרדי ויתדלק את חוסר הסובלנות הדתית שתסמן את האזור במדינה. המאה ה-15 וה-16 לספירה.האידיאולוגיה של הרקונקיסטה והפצת הנצרות באמצעות אלימות יושמו גם על הכיבושים הספרדים והפורטוגזים של העולם החדש בעקבות מסעו של כריסטופר קולומבוס בשנת 1492 לספירה.