באביב 492 לפני הספירה הורכב כוח משלחת, בפיקודו של חתנו של דריוש מרדוניוס, המורכב מצי וצבא יבשה.בעוד שהמטרה הסופית הייתה להעניש את אתונה ואריתריה, המשלחת שמה לה למטרה להכניע כמה שיותר מערי יוון .ביציאה מקיליקיה, שלח מרדוניוס את הצבא לצעוד להלספונט, בזמן שהוא נסע עם הצי.הוא הפליג סביב חופי אסיה הקטנה עד ליוניה, שם בילה זמן קצר בביטול העריצות ששלטו בערי יוניה.למרבה האירוניה, מכיוון שהקמת דמוקרטיות היוותה גורם מפתח במרד היוני, הוא החליף את העריצות בדמוקרטיות. ניתן לראות את כינון הדמוקרטיה של מרדוניוס כאן כניסיון להרגיע את איוניה, ולאפשר להגן על האגף שלו ככל שהוא מתקדם לעבר הלספונט ואז אל אתונה ואריתריה.משם המשיך הצי אל הלספונט, וכשהכל היה מוכן, שלח את כוחות היבשה לאירופה.לאחר מכן צעד הצבא דרך תראקיה, והכניע אותה מחדש, שכן אדמות אלו נוספו כבר לאימפריה הפרסית בשנת 512 לפני הספירה, במהלך המערכה של דריוש נגד הסקיתים.כשהגיעו למוקדון, הכריחו אותה הפרסים להפוך לחלק כפוף לחלוטין מהאימפריה הפרסית;הם היו וסאלים של הפרסים מאז סוף המאה ה-6 לפני הספירה, אך שמרו על האוטונומיה הכללית שלהם.בינתיים, הצי עבר לתאסוס, וכתוצאה מכך התאסים נכנעו לפרסים.לאחר מכן הקיף הצי את קו החוף עד אקנתוס שבכלקידיצה, לפני שניסה להקיף את הלשון של הר אתוס.עם זאת, הם נקלעו לסערה עזה, שהובילה אותם אל קו החוף של אתוס, והרסה (לפי הרודוטוס) 300 ספינות, עם אובדן של 20,000 איש.לאחר מכן, בזמן שהצבא חנה במקדון, פתחו הבריגים, שבט תראקי מקומי, בפשיטה לילית נגד המחנה הפרסי, הרגו רבים מהפרסים ופצעו את מרדוניוס.למרות פציעתו, מרדוניוס דאג שהברייג'יאנים יובסו ויוכפפו, לפני שהוביל את צבאו בחזרה להלספונט;גם שרידי הצי נסוגו לאסיה.אף על פי שהמערכה הזו הסתיימה בצורה מחפירה, הגישות היבשתיות ליוון הובטחו, והיוונים ללא ספק הודעו על כוונותיו של דריוש כלפיהם.