המרד היוני, והמרידות הקשורות אליו באאוליס, דוריס, קפריסין וקאריה, היו מרידות צבאיות של כמה אזורים יווניים באסיה הקטנה נגד השלטון הפרסי , שנמשכו בין השנים 499 לפנה"ס עד 493 לפנה"ס.בלב המרד עמדה חוסר שביעות הרצון של הערים היווניות באסיה הקטנה מהעריצים שמונו על ידי פרס לשלוט בהן, יחד עם פעולותיהם האישיות של שני עריצים מילזיים, היסטיאוס ואריסטגורס.ערי יוניה נכבשו על ידי פרס בסביבות שנת 540 לפני הספירה, ולאחר מכן נשלטו על ידי עריצים ילידים, שנבחרו על ידי הסטראפ הפרסי בסרדיס.בשנת 499 לפנה"ס פתח הצורר של מילטוס, אריסטגוראס, משלחת משותפת עם הסטראפ הפרסי ארטאפרנס לכיבוש נקסוס, בניסיון לחזק את מעמדו.המשימה הייתה תקלה, ובתחושת סילוקו הקרובה כעריץ, בחר אריסטגורס להסית את יוניה כולה למרד נגד המלך הפרסי דריוש הגדול.המרד היוני היווה את הסכסוך הגדול הראשון בין יוון לאימפריה הפרסית , וככזה מייצג את השלב הראשון של מלחמות יוון-פרס.למרות שאסיה הקטנה הוחזרה לחיק הפרסי, דריוש נשבע להעניש את אתונה ואריתריה על תמיכתן במרד.יתרה מכך, בראותו כי שלל מדינות הערים של יוון מהוות איום מתמשך על יציבות האימפריה שלו, לפי הרודוטוס, החליט דריוש לכבוש את יוון כולה.בשנת 492 לפנה"ס, החלה הפלישה הפרסית הראשונה ליוון, השלב הבא של מלחמות יוון-פרס, כתוצאה ישירה של המרד היוני.