برخی از اشراف مجارستانی پیشنهاد کردند که فردیناند، که فرمانروای اتریش همسایه بود و از طریق ازدواج با خانواده لویی دوم پیوند خورده بود، پادشاه مجارستان شود، با استناد به توافقات قبلی مبنی بر اینکه هابسبورگ ها تاج و تخت مجارستان را در صورت مرگ لوئی بدون وارث به دست خواهند گرفت.با این حال، دیگر اشراف به نجیب جان زاپولیا، که مورد حمایت سلیمان بود، روی آوردند.در زمان چارلز پنجم و برادرش فردیناند اول، هابسبورگ ها بودا را دوباره اشغال کردند و مجارستان را در اختیار گرفتند.زاپولیا حاضر نشد از ادعای خود برای تاج و تخت مجارستان چشم پوشی کند و به همین دلیل از سلیمان برای به رسمیت شناختن در ازای خراج درخواست کرد.سلیمان در فوریه زاپلیا را به عنوان دست نشانده خود پذیرفت و در ماه مه 1529 سلیمان شخصاً کارزار خود را آغاز کرد. در 26 تا 27 اوت سلیمان بودا را محاصره کرد و محاصره آغاز شد.دیوارها بر اثر شلیک توپ و تفنگ شدید عثمانی ها بین 5 تا 7 سپتامبر تخریب شد.آمادگی نظامی، حملات بی وقفه و ویرانی های جسمی و روانی که توسط توپخانه عثمانی ایجاد شده بود، تأثیر مطلوب را داشت.مزدوران آلمانی تسلیم شدند و قلعه را در 8 سپتامبر به عثمانی ها واگذار کردند.جان زاپولیا به عنوان دست نشاندۀ سلیمان در بودا مستقر شد. پس از شکست فردیناند، به حامیانش قول عبور امن از شهر داده شد، اما سربازان عثمانی آنها را بیرون از دیوارهای شهر سلاخی کردند.