Η Ύστερη Περίοδος της αρχαίας Αιγύπτου, που εκτείνεται από το 664 έως το 332 π.Χ., σηματοδότησε την τελική φάση της ιθαγενούς αιγυπτιακής κυριαρχίας και περιλάμβανε την περσική κυριαρχία στην περιοχή.Αυτή η εποχή ξεκίνησε μετά την Τρίτη Ενδιάμεση Περίοδο και την κυριαρχία της 25ης Δυναστείας των Νουβίων, ξεκινώντας από τη Δυναστεία των Σαϊτών που ιδρύθηκε από τον Ψαμτίκ Α΄ υπό την επιρροή των Νεο-Ασσυρίων .Η 26η Δυναστεία, γνωστή και ως Δυναστεία των Σαϊτών, βασίλεψε από το 672 έως το 525 π.Χ., εστιάζοντας στην επανένωση και την επέκταση.Ο Ψαμτίκ Α' ξεκίνησε την ενοποίηση γύρω στο 656 π.Χ., η ίδια άμεση συνέπεια της Ασσυριακής λεηλασίας της Θήβας.Ξεκίνησε η κατασκευή καναλιών από τον Νείλο έως την Ερυθρά Θάλασσα.Αυτή η περίοδος είδε διευρυμένη αιγυπτιακή επιρροή στην Εγγύς Ανατολή και σημαντικές στρατιωτικές αποστολές, όπως αυτές του Ψαμτίκ Β΄ στη Νουβία.^[69] Ο Πάπυρος του Μπρούκλιν, ένα αξιόλογο ιατρικό κείμενο αυτής της εποχής, αντανακλά τις εξελίξεις της εποχής.^[70] Η τέχνη αυτής της περιόδου συχνά απεικόνιζε λατρείες ζώων, όπως ο θεός Παταϊκός με ζωώδη χαρακτηριστικά.^[71]Η πρώτη περίοδος των Αχαιμενιδών (525–404 π.Χ.) ξεκίνησε με τη Μάχη του Πηλουσίου, κατά την οποία η Αίγυπτος κατακτήθηκε από την επεκτατική Αχαιμενιδική Αυτοκρατορία υπό τον Καμβύση και η Αίγυπτος έγινε σατραπεία.Αυτή η δυναστεία περιελάμβανε Πέρσες αυτοκράτορες όπως ο Καμβύσης, ο Ξέρξης Α' και ο Μέγας Δαρείος, και ήταν μάρτυρες εξεγέρσεων όπως αυτή του Ινάρου Β', υποστηριζόμενες από τους Αθηναίους .Πέρσες σατράπες, όπως οι Αρυάνδης και ο Αχαιμένης, κυβέρνησαν την Αίγυπτο κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου.Η 28η έως την 30η Δυναστεία αντιπροσώπευε το τελευταίο τμήμα της σημαντικής γηγενούς κυριαρχίας της Αιγύπτου.Η 28η Δυναστεία, που διήρκεσε από το 404 έως το 398 π.Χ., παρουσίαζε έναν μόνο βασιλιά, τον Αμυρταίο.Η 29η Δυναστεία (398–380 π.Χ.) είδε ηγεμόνες όπως ο Χάκορ να πολεμούν τις περσικές εισβολές.Η 30η Δυναστεία (380–343 π.Χ.), επηρεασμένη από την τέχνη της 26ης Δυναστείας, έληξε με την ήττα του Νεκτάνεβο Β΄, οδηγώντας στην εκ νέου προσάρτηση από την Περσία.Η δεύτερη περίοδος των Αχαιμενιδών (343–332 π.Χ.) σηματοδότησε την 31η Δυναστεία, με τους Πέρσες αυτοκράτορες να κυβερνούν ως Φαραώ μέχρι την κατάκτηση του Μεγάλου Αλεξάνδρου το 332 π.Χ.Αυτό μετέφερε την Αίγυπτο στην ελληνιστική περίοδο υπό τη Δυναστεία των Πτολεμαίων που ιδρύθηκε από τον Πτολεμαίο Α' Σώτερ, έναν από τους στρατηγούς του Αλεξάνδρου.Η Ύστερη Περίοδος είναι σημαντική για τις πολιτιστικές και πολιτικές μεταβάσεις της, που οδήγησαν στην τελική ενσωμάτωση της Αιγύπτου στον ελληνιστικό κόσμο.