Přibližně v této době poslal dopis papeži Inocenci III., ve kterém ho vyzval, aby vyslal do Bulharska vyslance.Chtěl přesvědčit papeže, aby uznal jeho vládu v Bulharsku.Innocent dychtivě vstoupil do korespondence s Kaloyanem, protože znovusjednocení křesťanských denominací pod jeho autoritou bylo jedním z jeho hlavních cílů.Vyslanec Innocenta III. přijel do Bulharska koncem prosince 1199 a přinesl Kaloyanovi dopis od papeže.Innocent uvedl, že byl informován, že Kaloyanovi předkové přišli „z města Říma“.Kaloyanova odpověď psaná ve staroslověnštině se nedochovala, ale její obsah lze rekonstruovat na základě jeho pozdější korespondence se Svatým stolcem.Kaloyan se stylizoval jako „císař Bulharů a Vlachů“ a tvrdil, že je legitimním nástupcem vládců první bulharské říše .Požadoval od papeže císařskou korunu a vyjádřil přání dát bulharskou pravoslavnou církev pod papežovu jurisdikci.Podle Kaloyanova dopisu papeži byl Alexios III ochoten poslat mu císařskou korunu a uznat autokefální (nebo autonomní) status bulharské církve.