Během 2. světové válkyItálie za Benita Mussoliniho okupovala Černou Horu v roce 1941 a připojila k Italskému království oblast Kotor (Cattaro), kde žilo malé benátsky mluvící obyvatelstvo.Loutkové Království Černé Hory bylo vytvořeno pod fašistickou kontrolou, zatímco Krsto Zrnov Popović se vrátil ze svého exilu v Římě v roce 1941, aby se pokusil vést Zelenaši (strana „zelených“), která podporovala obnovení černohorské monarchie.Tato milice se nazývala Lovćenská brigáda.Černá Hora byla zpustošena strašlivou partyzánskou válkou, hlavně poté, co nacistické Německo vystřídalo v září 1943 poražené Italy.Během druhé světové války, stejně jako v mnoha jiných částech Jugoslávie, byla Černá Hora zapojena do jakési občanské války.Kromě černohorských zelených byly dvěma hlavními frakcemi Četnická jugoslávská armáda, která přísahala věrnost exilové vládě a skládala se převážně z Černohorců, kteří se hlásili k Srbům (mnoho z jejích členů byli černohorští běloši) a jugoslávských partyzánů, jejichž cílem bylo vytvoření socialistické Jugoslávie po válce.Protože obě frakce sdílely některé podobnosti ve svých cílech, zejména ty, které se týkaly sjednocené Jugoslávie a odporu proti Ose, spojily se obě strany a v roce 1941 zahájily povstání 13. července, první organizované povstání v okupované Evropě.K tomu došlo pouhé dva měsíce poté, co Jugoslávie kapitulovala a osvobodila většinu území Černé Hory, ale rebelové nebyli schopni znovu získat kontrolu nad velkými městy.Po neúspěšných pokusech o osvobození měst Pljevlja a Kolasin dobyli Italové, posíleni Němci, zpět všechna povstalecká území.Na úrovni vedení nakonec neshody ohledně státní politiky (centralistická monarchie vs. federativní socialistická republika) vedly k rozkolu mezi oběma stranami;odtud se pak stali nepřáteli.Neustále se obě frakce snažily získat podporu mezi obyvatelstvem.Nicméně, nakonec Chetniks v Černé Hoře ztratil podporu mezi obyvatelstvem, jak dělal jiné Chetnik frakce uvnitř Jugoslávie.De facto vůdce Četníků v Černé Hoře, Pavle Djurisic, spolu s dalšími prominentními postavami hnutí, jako byli Dušan Arsovic a Đorđe Lašić, byli zodpovědní za masakry muslimského obyvatelstva ve východní Bosně a Sandžaku během roku 1944. Jejich ideologie homogenního Srbska v Jugoslávii se ukázalo být hlavní překážkou při náboru liberálů, menšin a Černohorců, kteří považovali Černou Horu za národ s vlastní identitou.Tyto faktory, kromě toho, že někteří Četníci vyjednávali s Osou, vedly k tomu, že Četnická jugoslávská armáda ztratila podporu mezi Spojenci v roce 1943. Ve stejném roce kapitulovala Itálie, která měla do té doby na starosti okupovanou zónu. a byl nahrazen Německem a boje pokračovaly.Podgorica byla osvobozena socialistickými partyzány 19. prosince 1944 a osvobozovací válka byla vyhrána.Josip Broz Tito uznal obrovský přínos Černé Hory k válce proti mocnostem Osy tím, že ji ustanovil jako jednu ze šesti republik Jugoslávie.