ግሪኮች እስከ 1460 ድረስ በፔሎፖኔዝ ውስጥ ቆይተዋል ፣ እና ቬኔሲያውያን እና ጄኖዎች ከአንዳንድ ደሴቶች ጋር ተጣበቁ ፣ ግን በ 16 ኛው ክፍለ ዘመን መጀመሪያ ላይ ሁሉም ዋና ግሪክ እና አብዛኛው የኤጅያን ደሴቶች በኦቶማን ኢምፓየር ቅኝ ተገዝተው ነበር ፣ አሁንም በርካታ የወደብ ከተሞችን ሳያካትት በቬኒስ (ናፍፕሊዮ, ሞኔምቫሲያ, ፓርጋ እና ሜቶን በጣም አስፈላጊ የሆኑት) በቬኒስ ተይዘዋል.በኤጂያን መሀል የሚገኙት የሳይክላድስ ደሴቶች በ1579 በኦቶማኖች በይፋ ተያዙ፣ ምንም እንኳን ከ1530ዎቹ ጀምሮ በቫሳል ደረጃ ላይ ቢሆኑም።ቆጵሮስ በ1571 ወደቀች፣ እና ቬኔሲያኖች ቀርጤስን እስከ 1669 ቆዩ። የአዮኒያ ደሴቶች ከከፋሎኒያ (ከ1479 እስከ 1481 እና ከ1485 እስከ 1500) በስተቀር በኦቶማን አይገዙም ነበር እና በቬኒስ ሪፐብሊክ አገዛዝ ስር ቆዩ። .እ.ኤ.አ. በ 1800 የሰባት ደሴቶች ሪፐብሊክ ሲፈጠር ዘመናዊ የግሪክ ግዛት በተወለደበት በአዮኒያ ደሴቶች ውስጥ ነበር ።ኦቶማን ግሪክ የብዙ ጎሳ ማህበረሰብ ነበረች።ይሁን እንጂ የዘመናዊው የምዕራቡ ዓለም የመድብለ ባሕላዊ አስተሳሰብ ምንም እንኳን በመጀመሪያ ሲታይ ምንም እንኳን ከወፍጮዎች ስርዓት ጋር የሚጣጣም ቢመስልም ከኦቶማን ስርዓት ጋር የማይጣጣም ነው ተብሎ ይታሰባል.ግሪኮች በአንድ በኩል አንዳንድ መብቶች እና ነፃነት ተሰጥቷቸዋል;በሌላ በኩል ደግሞ ማእከላዊው መንግስት የርቀት እና ያልተሟላ ቁጥጥር ባለበት የአስተዳደር ሰራተኞች ብልሹ አሰራር ለመጣው አምባገነንነት ተጋልጠዋል።ኦቶማኖች ሲደርሱ ሁለት የግሪክ ፍልሰት ተፈጠረ።የመጀመሪያው ፍልሰት የግሪክ ምሁራኖች ወደ ምዕራብ አውሮፓ እንዲሰደዱ እና በህዳሴ መምጣት ላይ ተጽእኖ እንዲያሳድሩ አድርጓል።ሁለተኛው ፍልሰት ግሪኮች የግሪክን ባሕረ ገብ መሬት ሜዳ ትተው በተራሮች ላይ እንዲሰፍሩ አድርጓል።የወፍጮው ስርዓት በኦቶማን ኢምፓየር ውስጥ ያሉትን የተለያዩ ህዝቦች በሃይማኖት በመለየት ለኦርቶዶክስ ግሪኮች የዘር ውህደት አስተዋፅዖ አድርጓል።በኦቶማን የግዛት ዘመን በሜዳ ላይ ይኖሩ የነበሩት ግሪኮች የውጭ አገዛዝን ሸክም የሚቋቋሙ ክርስቲያኖች ወይም ክሪፕቶ-ክርስቲያኖች (የግሪክ ኦርቶዶክስ እምነት ምስጢራዊ የግሪክ ሙስሊሞች) ነበሩ።አንዳንድ ግሪኮች ከባድ ቀረጥ ለማስወገድ እና በተመሳሳይ ጊዜ ከግሪክ ኦርቶዶክስ ቤተክርስቲያን ጋር ያላቸውን ግንኙነት በመጠበቅ ማንነታቸውን ለመግለጽ ክሪፕቶ-ክርስቲያን ሆኑ።ነገር ግን ግሪኮች እስልምናን የተቀበሉ እና ክሪፕቶ-ክርስቲያን ያልነበሩ ግሪኮች የቱርክ ቋንቋ ባይቀበሉም በኦርቶዶክስ ግሪኮች ዘንድ “ቱርኮች” (ሙስሊም) ተደርገው ይቆጠሩ ነበር።ኦቶማኖች አብዛኛውን ግሪክን እስከ 19ኛው ክፍለ ዘመን መጀመሪያ ድረስ ይገዙ ነበር።ከመካከለኛው ዘመን ጀምሮ የመጀመሪያው ራሱን የሚያስተዳድር፣ የሄለኒክ መንግሥት የተመሰረተው በፈረንሳይ አብዮታዊ ጦርነቶች፣ በ1800፣ የግሪክ አብዮት በዋና ምድር ግሪክ ከመፈንደዱ 21 ዓመታት በፊት ነው።ኮርፉ ዋና ከተማ የሆነችው ሴፕቲንስላር ሪፐብሊክ ነበረች።