Với việc Anatolia rơi vào tình trạng hỗn loạn trên thực tế và quân đội Ottoman tỏ ra trung thành một cách đáng ngờ để phản ứng lại việc Đồng minh chiếm đất, Mehmed VI đã thành lập hệ thống thanh tra quân sự để thiết lập lại quyền lực đối với đế chế còn lại.Được Karabekir và Edmund Allenby khuyến khích, ông giao cho Mustafa Kemal Pasha (Atatürk) làm thanh tra của Thanh tra Quân đoàn 9 – có trụ sở tại Erzurum – để lập lại trật tự cho các đơn vị quân đội Ottoman và cải thiện an ninh nội bộ vào ngày 30 tháng 4 năm 1919. Mustafa Kemal là một chỉ huy quân đội nổi tiếng, được kính trọng và có mối quan hệ tốt, với nhiều uy tín đến từ địa vị là "Anh hùng của Anafartalar" - vì vai trò của ông trong Chiến dịch Gallipoli - và danh hiệu "Phụ tá danh dự cho Quốc vương Bệ hạ". " đạt được trong những tháng cuối cùng của Thế chiến thứ nhất .Ông là một người theo chủ nghĩa dân tộc và là người chỉ trích gay gắt chính sách dễ dãi của chính phủ đối với các cường quốc Entente.Mặc dù là thành viên của CUP, nhưng ông thường xuyên xung đột với Ủy ban Trung ương trong chiến tranh và do đó bị gạt sang bên lề quyền lực, có nghĩa là ông là người theo chủ nghĩa dân tộc hợp pháp nhất để Mehmed VI xoa dịu.Trong môi trường chính trị mới này, ông đã tìm cách tận dụng những chiến công trong chiến tranh của mình để đạt được một công việc tốt hơn, thực tế là ông đã nhiều lần vận động hành lang không thành công để được đưa vào nội các với tư cách là Bộ trưởng Chiến tranh.Nhiệm vụ mới của anh ấy đã trao cho anh ấy quyền lực toàn quyền hiệu quả đối với toàn bộ Anatolia, nhằm hỗ trợ anh ấy và những người theo chủ nghĩa dân tộc khác để giữ họ trung thành với chính phủ.Mustafa Kemal trước đó đã từ chối trở thành thủ lĩnh của Tập đoàn quân số 6 có trụ sở tại Nusaybin.Nhưng theo Patrick Balfour, thông qua sự lôi kéo và sự giúp đỡ của bạn bè và những người đồng tình, anh ta trở thành thanh tra của hầu như tất cả các lực lượng Ottoman ở Anatolia, được giao nhiệm vụ giám sát quá trình giải tán của các lực lượng Ottoman còn lại.Kemal có vô số mối quan hệ và bạn bè cá nhân tập trung tại Bộ Chiến tranh Ottoman thời hậu đình chiến, một công cụ mạnh mẽ giúp anh ta hoàn thành mục tiêu bí mật của mình: lãnh đạo một phong trào dân tộc chủ nghĩa chống lại các cường quốc Đồng minh và một chính phủ Ottoman hợp tác.Một ngày trước khi khởi hành đến Samsun trên bờ Biển Đen xa xôi, Kemal có buổi yết kiến ​​cuối cùng với Mehmed VI.Anh ấy cam kết trung thành với sultan-caliph và họ cũng được thông báo về việc quân Hy Lạp đã chiếm đóng Smyrna (İzmir).Ông và những nhân viên được lựa chọn cẩn thận của mình rời Constantinople trên chiếc tàu hơi nước cũ SS Bandırma vào tối ngày 16 tháng 5 năm 1919.