Vào đầu thế kỷ 21, Singapore phải đối mặt với nhiều thách thức đáng kể, đáng chú ý nhất là dịch SARS bùng phát năm 2003 và mối đe dọa khủng bố ngày càng gia tăng.Năm 2001, một âm mưu đáng báo động nhắm vào các đại sứ quán và cơ sở hạ tầng quan trọng đã bị ngăn chặn, dẫn đến việc bắt giữ 15 thành viên của Jemaah Islamiyah.Vụ việc này đã thúc đẩy việc đưa ra các biện pháp chống khủng bố toàn diện nhằm phát hiện, ngăn chặn và giảm thiểu thiệt hại.Đồng thời, nền kinh tế quốc gia vẫn tương đối ổn định, với thu nhập trung bình hàng tháng của hộ gia đình năm 2003 được báo cáo là 4.870 đô la Singapore.Năm 2004, Lý Hiển Long, con trai cả của Lý Quang Diệu, lên giữ chức thủ tướng thứ ba của Singapore.Dưới sự lãnh đạo của ông, một số chính sách quốc gia mang tính chuyển đổi đã được đề xuất và thực hiện.Đáng chú ý, thời gian đào tạo nghĩa vụ quốc gia đã được rút ngắn từ hai năm rưỡi xuống còn hai năm 2005. Chính phủ cũng khởi xướng chương trình "Cắt băng đỏ", tích cực tìm kiếm phản hồi của người dân về một loạt vấn đề, từ khuôn khổ pháp lý đến các mối quan tâm xã hội.Cuộc tổng tuyển cử năm 2006 đánh dấu một bước ngoặt quan trọng trong bối cảnh chính trị Singapore, chủ yếu do ảnh hưởng chưa từng có của internet và blog, vốn vẫn chưa được chính phủ kiểm soát.Trong một động thái chiến lược ngay trước cuộc bầu cử, chính phủ đã phân phát tiền thưởng bằng tiền mặt "gói tiến bộ" cho tất cả công dân trưởng thành, với tổng trị giá 2,6 tỷ đô la Singapore.Bất chấp lượng cử tri đi bỏ phiếu lớn tại các cuộc biểu tình của phe đối lập, Đảng Hành động Nhân dân (PAP) cầm quyền vẫn giữ được thành trì của mình, giành được 82 trong số 84 ghế và giành được 66% số phiếu bầu.Mối quan hệ sau độc lập của Singapore với Malaysia rất phức tạp, thường có đặc điểm là những bất đồng nhưng lại được nhấn mạnh bởi sự phụ thuộc lẫn nhau.Là thành viên của ASEAN, cả hai quốc gia đều công nhận lợi ích chung của khu vực.Sự phụ thuộc lẫn nhau này càng được nhấn mạnh bởi sự phụ thuộc của Singapore vào Malaysia về một phần đáng kể nguồn cung cấp nước của nước này.Mặc dù cả hai nước đôi khi có những tranh cãi bằng lời nói do quỹ đạo hậu độc lập khác nhau, nhưng may mắn là họ đã tránh được những xung đột hoặc thù địch nghiêm trọng.