Năm 1965, đối mặt với căng thẳng leo thang và để ngăn chặn xung đột thêm, Thủ tướng Malaysia Tunku Abdul Rahman đề xuất trục xuất Singapore khỏi Malaysia .Khuyến nghị này sau đó đã được Quốc hội Malaysia phê chuẩn vào ngày 9 tháng 8 năm 1965, với một cuộc bỏ phiếu nhất trí ủng hộ việc tách Singapore.Cùng ngày, Thủ tướng Singapore Lý Quang Diệu đầy xúc động đã tuyên bố nền độc lập mới của quốc gia thành phố này.Trái ngược với niềm tin phổ biến rằng Singapore đã bị đơn phương trục xuất, các tài liệu gần đây tiết lộ rằng các cuộc thảo luận giữa Đảng Hành động Nhân dân (PAP) của Singapore và Liên minh Malaysia đã diễn ra kể từ tháng 7 năm 1964. Lee Kuan Yew và Goh Keng Swee, một lãnh đạo cấp cao của PAP, đã dàn dựng sự tách biệt theo cách được coi là một quyết định không thể thay đổi đối với công chúng, nhằm mang lại lợi ích cả về mặt chính trị và kinh tế.^[16]Sau khi tách ra, Singapore đã tiến hành sửa đổi hiến pháp để chuyển đổi thành bang thành Cộng hòa Singapore.Yusof Ishak, trước đây là Yang di-Pertuan Negara hay phó đại diện vương giả, được nhậm chức Tổng thống đầu tiên của Singapore.Trong khi đồng đô la Malaya và đồng đô la Borneo của Anh tiếp tục là tiền tệ hợp pháp trong một thời gian ngắn, các cuộc thảo luận về đồng tiền chung giữa Singapore và Malaysia đã được tổ chức trước khi đồng đô la Singapore được đưa vào sử dụng vào năm 1967. ^[17] Tại Malaysia, các ghế trong quốc hội trước đây đã được tổ chức. của Singapore được tái phân bổ cho Malaya, điều này làm thay đổi cán cân quyền lực và ảnh hưởng do các bang Sabah và Sarawak nắm giữ.Quyết định tách Singapore khỏi Malaysia đã vấp phải phản ứng mạnh mẽ, đặc biệt là từ các nhà lãnh đạo ở Sabah và Sarawak.Các nhà lãnh đạo này bày tỏ cảm giác bị phản bội và thất vọng vì không được hỏi ý kiến ​​trong quá trình ly thân. Thủ hiến bang Sabah, Fuad Stephens, bày tỏ sự đau buồn sâu sắc trong một bức thư gửi Lý Quang Diệu, trong khi các nhà lãnh đạo như Ong Kee Hui của Đảng Nhân dân Thống nhất Sarawak đặt câu hỏi lý do chính đáng cho sự tồn tại của Malaysia sau khi chia tách.Bất chấp những lo ngại này, Phó Thủ tướng Malaysia Abdul Razak Hussein vẫn bảo vệ quyết định này, cho rằng động thái này mang tính bí mật và cấp bách vì Cuộc đối đầu Indonesia-Malaysia đang diễn ra.^[18]