Agha Mohammad Khan, sau khi giành chiến thắng trong cuộc nội chiến sau cái chết của vị vua Zand cuối cùng, đã tập trung vào việc thống nhất và tập trung hóa Iran.^[54] Hậu Nader Shah và thời đại Zand, các lãnh thổ Caucasian của Iran đã hình thành nhiều hãn quốc khác nhau.Agha Mohammad Khan nhằm mục đích tái hợp nhất các khu vực này vào Iran, coi chúng là một phần không thể tách rời như bất kỳ lãnh thổ đại lục nào.Một trong những mục tiêu chính của ông là Georgia, nơi ông coi là quan trọng đối với chủ quyền của Iran.Ông yêu cầu vua Gruzia, Erekle II, từ bỏ hiệp ước năm 1783 với Nga và chấp nhận quyền thống trị của Ba Tư, nhưng Erekle II đã từ chối.Để đáp lại, Agha Mohammad Khan đã phát động một chiến dịch quân sự, tái khẳng định thành công quyền kiểm soát của Iran đối với nhiều vùng lãnh thổ của người da trắng, bao gồm Armenia , Azerbaijan , Dagestan và Igdir ngày nay.Ông đã chiến thắng trong Trận Krtsanisi, dẫn tới việc chiếm được Tbilisi và tái chinh phục Georgia một cách hiệu quả.^[55]Năm 1796, sau khi trở về từ chiến dịch thành công ở Georgia và vận chuyển hàng nghìn tù nhân Gruzia đến Iran, Agha Mohammad Khan chính thức lên ngôi Shah.Triều đại của ông bị cắt đứt do vụ ám sát vào năm 1797 khi đang lên kế hoạch cho một cuộc thám hiểm khác chống lại Georgia.Sau cái chết của ông, Nga đã tận dụng sự bất ổn trong khu vực.Năm 1799, quân Nga tiến vào Tbilisi và đến năm 1801, họ đã sáp nhập Georgia một cách hiệu quả.Sự mở rộng này đánh dấu sự khởi đầu của Chiến tranh Nga-Ba Tư (1804-1813 và 1826–1828), dẫn đến việc nhượng lại cuối cùng miền đông Georgia, Dagestan, Armenia và Azerbaijan cho Nga, như được quy định trong Hiệp ước Gulistan và Turkmenchay.Do đó, các vùng lãnh thổ phía bắc sông Aras, bao gồm Azerbaijan, miền đông Georgia, Dagestan và Armenia hiện nay, vẫn là một phần của Iran cho đến khi bị Nga chiếm đóng vào thế kỷ 19.^[56]Sau Chiến tranh Nga-Ba Tư và sự mất mát chính thức các vùng lãnh thổ rộng lớn ở Kavkaz, những thay đổi đáng kể về nhân khẩu học đã xảy ra.Các cuộc chiến tranh năm 1804–1814 và 1826–1828 đã dẫn đến những cuộc di cư lớn được gọi là Muhajirs của người da trắng đến lục địa Iran.Phong trào này bao gồm nhiều nhóm dân tộc khác nhau như Ayrums, Qarapapaqs, Circassians, Shia Lezgins và những người Hồi giáo Transcaucasian khác.^[57] Sau Trận Ganja năm 1804, nhiều người Ayrum và Qarapapaq được tái định cư ở Tabriz, Iran.Trong suốt cuộc chiến tranh 1804–1813 và sau đó là trong cuộc xung đột 1826–1828, nhiều nhóm trong số này từ các lãnh thổ mới được chinh phục của Nga đã di cư đến Solduz ở tỉnh Tây Azerbaijan ngày nay, Iran.^[58] Các hoạt động quân sự của Nga và các vấn đề quản lý ở vùng Kavkaz đã khiến một số lượng lớn người Hồi giáo và một số người theo đạo Cơ đốc Gruzia phải lưu vong ở Iran.^[59]Từ năm 1864 cho đến đầu thế kỷ 20, nhiều vụ trục xuất và di cư tự nguyện tiếp tục xảy ra sau chiến thắng của người Nga trong Chiến tranh Caucasian.Điều này dẫn đến các phong trào bổ sung của người Hồi giáo da trắng, bao gồm người Azerbaijan, người Hồi giáo người Transcaucasian khác và các nhóm người Bắc Caucasian như Circassians, Shia Lezgins và Laks, hướng tới Iran và Thổ Nhĩ Kỳ.^[57] Nhiều người trong số những người di cư này đóng vai trò quan trọng trong lịch sử Iran, tạo thành một bộ phận quan trọng của Lữ đoàn Cossack Ba Tư được thành lập vào cuối thế kỷ 19.^[60]Hiệp ước Turkmenchay năm 1828 cũng tạo điều kiện thuận lợi cho việc tái định cư của người Armenia từ Iran đến các vùng lãnh thổ mới do Nga kiểm soát.^[61] Trong lịch sử, người Armenia chiếm đa số ở Đông Armenia nhưng trở thành thiểu số sau các chiến dịch của Timur và sự thống trị của Hồi giáo sau đó.^[62] Cuộc xâm lược Iran của Nga đã làm thay đổi thêm thành phần dân tộc, dẫn đến việc người Armenia chiếm đa số ở Đông Armenia vào năm 1832. Sự thay đổi nhân khẩu học này càng được củng cố sau Chiến tranh Krym và Chiến tranh Nga-Thổ Nhĩ Kỳ năm 1877–1878.^[63]Trong thời kỳ này, Iran đã trải qua sự tham gia ngoại giao ngày càng tăng của phương Tây dưới thời Fath Ali Shah.Cháu trai của ông, Mohammad Shah Qajar, chịu ảnh hưởng của Nga, đã cố gắng chiếm Herat nhưng không thành công.Naser al-Din Shah Qajar, người kế nhiệm Mohammad Shah, là một nhà cai trị thành công hơn, thành lập bệnh viện hiện đại đầu tiên của Iran.^[64]Nạn đói lớn ở Ba Tư năm 1870–1871 là một sự kiện thảm khốc, khiến khoảng hai triệu người thiệt mạng.^[65] Thời kỳ này đánh dấu một bước chuyển tiếp quan trọng trong lịch sử Ba Tư, dẫn đến Cách mạng Hiến pháp Ba Tư chống lại Shah vào cuối thế kỷ 19 và đầu thế kỷ 20.Bất chấp những thách thức, Shah đã chấp nhận một hiến pháp hạn chế vào năm 1906, biến Ba Tư thành một chế độ quân chủ lập hiến và dẫn đến việc triệu tập Majlis (quốc hội) đầu tiên vào ngày 7 tháng 10 năm 1906.Việc người Anh phát hiện ra dầu mỏ vào năm 1908 tại Khuzestan đã tăng cường lợi ích nước ngoài ở Ba Tư, đặc biệt là của Đế quốc Anh (có liên quan đến William Knox D'Arcy và Công ty Dầu mỏ Anh-Iran, nay là BP).Thời kỳ này cũng được đánh dấu bởi sự cạnh tranh địa chính trị giữa Vương quốc Anh và Nga về Ba Tư, được gọi là Trò chơi vĩ đại.Công ước Anh-Nga năm 1907 đã chia Ba Tư thành các vùng ảnh hưởng, làm suy yếu chủ quyền quốc gia của nước này.Trong Thế chiến thứ nhất , Ba Tư bị quân Anh, Ottoman và Nga chiếm đóng nhưng phần lớn vẫn giữ thái độ trung lập.Sau Thế chiến thứ nhất và Cách mạng Nga , Anh đã cố gắng thiết lập một chế độ bảo hộ đối với Ba Tư nhưng cuối cùng đã thất bại.Sự bất ổn ở Ba Tư, nổi bật là phong trào Lập hiến ở Gilan và sự suy yếu của chính phủ Qajar, đã mở đường cho sự trỗi dậy của Reza Khan, sau này là Reza Shah Pahlavi, và sự thành lập triều đại Pahlavi vào năm 1925. Một cuộc đảo chính quân sự quan trọng năm 1921 đã dẫn đầu của Reza Khan thuộc Lữ đoàn Cossack Ba Tư và Seyyed Zia'eddin Tabatabai, ban đầu nhằm mục đích kiểm soát các quan chức chính phủ hơn là trực tiếp lật đổ chế độ quân chủ Qajar.^[66] Ảnh hưởng của Reza Khan ngày càng lớn, và đến năm 1925, sau khi giữ chức thủ tướng, ông trở thành Shah đầu tiên của triều đại Pahlavi.