1511 میں ملاکا پرتگالیوں کے قبضے میں چلا گیا اور سلطان محمود شاہ ملاکا سے بھاگنے پر مجبور ہو گیا۔سلطان نے دارالحکومت پر دوبارہ قبضہ کرنے کی کئی کوششیں کیں لیکن اس کی کوششیں بے سود رہیں۔پرتگالیوں نے جوابی کارروائی کی اور سلطان کو پہانگ بھاگنے پر مجبور کر دیا۔بعد میں، سلطان بنتن کی طرف روانہ ہوا اور وہاں ایک نیا دارالحکومت قائم کیا۔ایک اڈے کے قیام کے ساتھ، سلطان نے بے ترتیب مالائی افواج کو اکٹھا کیا اور پرتگالی پوزیشن کے خلاف کئی حملوں اور ناکہ بندیوں کا اہتمام کیا۔پیکان توا، سنگائی تلور، جوہر میں قائم جوہر سلطنت کی بنیاد راجہ علی ابنی سلطان محمود میلاکا نے رکھی تھی، جسے سلطان علاؤالدین ریاض شاہ دوم (1528–1564) کے نام سے جانا جاتا ہے، ^[1528] میں۔ ملاکا میں پرتگالیوں اور سماٹرا میں اچینیوں کے حملوں کا مقابلہ کرنا پڑا، وہ جوہر سلطنت پر اپنی گرفت برقرار رکھنے میں کامیاب رہے۔ملاکا پر متواتر چھاپوں کی وجہ سے پرتگالیوں کو شدید مشکلات کا سامنا کرنا پڑا اور اس سے پرتگالیوں کو جلاوطن سلطان کی افواج کو تباہ کرنے پر راضی کرنے میں مدد ملی۔مالے کو دبانے کی کئی کوششیں کی گئیں لیکن 1526 تک پرتگالیوں نے بنتن کو زمین بوس کر دیا۔اس کے بعد سلطان سماٹرا میں کمپار چلا گیا اور دو سال بعد اس کی موت ہو گئی۔آپ نے اپنے پیچھے دو بیٹے مظفر شاہ اور علاؤالدین ریاض شاہ دوم چھوڑے ہیں۔^[53] مظفر شاہ پیرک کو قائم کرتا رہا جبکہ علاؤالدین ریاض شاہ جوہر کا پہلا سلطان بنا۔^[53]