Династія Хоразміїв, заснована в Ірані, проіснувала лише до монгольської навали під керівництвом Чингісхана .До 1218 року Монгольська імперія, яка швидко розросталася, межувала з територією Хоразмія.Ала ад-Дін Мухаммад, хорезмійський правитель, розширив своє царство на більшу частину Ірану та оголосив себе шахом, домагаючись визнання від аббасидського халіфа Ан-Насіра, але йому було відмовлено.Монгольське вторгнення в Іран почалося в 1219 році після того, як його дипломатичні місії в Хорезмі були вбиті.Вторгнення було жорстоким і всеосяжним;такі великі міста, як Бухара, Самарканд, Герат, Тус і Нішапур, були зруйновані, а їхнє населення було вбито.Ала ад-Дін Мухаммед утік і зрештою помер на острові в Каспійському морі.Під час цього вторгнення монголи застосували передову військову техніку, включаючи використання китайських катапульт і, можливо, порохових бомб.Китайські воїни, які володіли пороховою технологією, входили до складу монгольської армії.Вважається, що монгольське завоювання привело до Центральної Азії китайську порохову зброю, включно з хуочонгом (мортирою).Подальша місцева література описувала порохову зброю, подібну до тієї, що використовувалася вКитаї .Монгольська навала, кульмінацією якої стала смерть Чингісхана в 1227 році, була руйнівною для Ірану.Це призвело до значних руйнувань, у тому числі пограбування міст у західному Азербайджані .Монголи, незважаючи на те, що пізніше прийняли іслам та асимілювалися з іранською культурою, завдали непоправної шкоди.Вони знищили багатовікову ісламську науку, культуру та інфраструктуру, зруйнувавши міста, спаливши бібліотеки та замінивши мечеті буддистськими храмами в деяких районах.^[38]Вторгнення також мало катастрофічний вплив на цивільне життя Ірану та інфраструктуру країни.Руйнування іригаційних систем Канат, особливо в північно-східному Ірані, порушило структуру поселень, що призвело до залишення багатьох колись процвітаючих сільськогосподарських міст.^[39]Після смерті Чингісхана Іраном керували різні монгольські командири.Хулагу-хан, онук Чингіза, відповідав за подальше розширення монгольської влади на захід.Однак до його часу Монгольська імперія розпалася на різні фракції.Хулагу заснував Ільханат в Ірані, державі, що відкололася від Монгольської імперії, яка правила протягом вісімдесяти років і дедалі більше персізувалася.У 1258 році Хулагу захопив Багдад і стратив останнього аббасидського халіфа.Його експансія була зупинена в битві при Айн-Джалуті в Палестині в 1260 році мамелюками.Крім того, походи Хулагу проти мусульман спричинили конфлікт із Берке, мусульманським ханом Золотої Орди , що підкреслило розпад монгольської єдності.При Газані (правління 1295–1304), правнуку Хулагу, іслам був встановлений як державна релігія Ільханату.Газан разом зі своїм іранським візиром Рашидом ад-Діном ініціював економічне відродження в Ірані.Вони зменшили податки для ремісників, сприяли розвитку сільського господарства, відновили іригаційні роботи та посилили безпеку торгових шляхів, що призвело до сплеску торгівлі.Ці події сприяли культурному обміну в Азії, збагачуючи іранську культуру.Помітним результатом стала поява нового стилю іранського живопису, який змішав месопотамські та китайські художні елементи.Однак після смерті племінника Газана Абу Саїда в 1335 році Ілханат поринув у громадянську війну і розпався на кілька менших династій, включаючи Джалаїридів, Музаффаридів, Сарбадарів і Картідів.XIV століття також стало свідком руйнівного впливу Чорної смерті, яка вбила приблизно 30% населення Ірану.^[40]