ในการเสียชีวิตของ Feodor ที่ไม่มีบุตรเมื่อวันที่ 7 มกราคม ค.ศ. 1598 เช่นเดียวกับการลอบสังหาร Dimitry น้องชายคนเล็กของ Feodor ที่มีข่าวลือทำให้บอริสขึ้นสู่อำนาจการเลือกตั้งของเขาเสนอโดยพระสังฆราชจ็อบแห่งมอสโกซึ่งเชื่อว่าบอริสเป็นชายคนเดียวที่สามารถรับมือกับความยากลำบากของสถานการณ์ได้อย่างไรก็ตาม บอริสจะยอมรับบัลลังก์จาก Zemsky Sobor (สมัชชาแห่งชาติ) เท่านั้น ซึ่งประชุมเมื่อวันที่ 17 กุมภาพันธ์ และเลือกเขาอย่างเป็นเอกฉันท์ในวันที่ 21 กุมภาพันธ์ในวันที่ 1 กันยายน เขาสวมมงกุฎซาร์อย่างเคร่งขรึมเขาตระหนักถึงความจำเป็นที่รัสเซียจะต้องตามให้ทันความก้าวหน้าทางปัญญาของตะวันตก และพยายามอย่างดีที่สุดเพื่อนำมาซึ่งการปฏิรูปการศึกษาและสังคมเขาเป็นซาร์คนแรกที่นำเข้าครูต่างชาติเป็นจำนวนมาก เป็นคนแรกที่ส่งเยาวชนชาวรัสเซียไปต่างประเทศเพื่อรับการศึกษา และเป็นคนแรกที่อนุญาตให้มีการสร้างโบสถ์นิกายลูเธอรันในรัสเซีย